1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtattttattcttattgctgtgagtttgctgatctatttttttttcctttttagaacaccatgtttcttgatacatagtgagtgttcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGTGGGGTGATTCTTTATGCTCTTCTTTGTGGAACTCTTCCATTTGATGATG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G107867_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGGAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGTEST: gi|148999574|gb|EE036551.2|EE036551
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGT
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGTEST: gi|89758870|gb|DY687889.1|DY687889
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGT
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGTEST: gi|60359581|gb|DN226554.1|DN226554
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGT
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGTEST: gi|71447675|gb|DR828725.1|DR828725
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGT
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGANGTCGATGTATGGAGTTGTEST: gi|211440538|gb|FL230375.1|FL230375
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGT
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGCEST: gi|211440534|gb|FL230371.1|FL230371
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGT
EST: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAG GTAATATCTGGGTAA-CTATATGCTGGACCTGAG
genomic: GCCATTTTCTGAAGACTAGCTGTGGGAGTCCGAACTATGCTGCTCCAGAGgtattttatt ... tcttttgcagGTAATATCTGG-TAAACTATATGCTGGACCTGAG
tttttcctttttagaacaccatgtttcttgatacatagtgagtgttcttttgcagGTAATATCTGGTAAACTATATGCTGGACCTGAGGTCGATGTATGGAGTTGTGGGGTGATTCTTTATGCTCTTCTTTGTGGAACTCTTCCATTTGATGATG
tcttgat putative branch site (score: 4)
tgttctttt putative PPT
tttttagaa TA-rich tract