ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

General
Orthologs
EST
RNA-Seq
PPT, BS, UA-tract

Sequence

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

gtgactcgtttgttttggttattacaccttcatttttctctaagttgcatgatctatgcataatggctttcttttcttttttgaactttaatgattgttctcttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATG

Basic information

species	Zea mays
transcript	GRMZM2G102596_T01
intron #	4
splice site	3'
intron type	U2

Orthologous splice sites

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

upper sequence: GRMZM2G102596_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os06g06030.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4

gtgactcgtttgttttggttattacaccttcatttttctctaagttgcatgatctatgcataatggctttcttttcttttttgaactttaatgattgttctcttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATG
                 || | | || | | |  |  || | | ||  | |   || |  ||   ||| | |  |  | | |     ||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |
-----------------gtgaattcagcct-acatgcctttga-ttagaagtcttaagtttatgtgctgtgtgctactctata---cttaatgtgttctatctcgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGATAGTGAGGGCGCAAGGCTCATGGGAAGCCGATTCTCTGTTGGATCAGGTTCTCTGTATGCCTATGGTATCTTGGACG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments

ATGC    EST sequence
ATGC    genomic sequence (exon)
ATGC    genomic sequence (truncated intron)

EST: gi|22521497|gb|BU080308.1|BU080308

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|45568022|gb|CK985863.1|CK985863

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32825185|gb|CD964907.1|CD964907

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|5268934|gb|AI770898.1|AI770898

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|31355758|gb|CD440115.1|CD440115

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|74235152|gb|DT643066.1|DT643066

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|21331860|gb|BQ487241.1|BQ487241

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTNCAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|149029425|gb|EE286206.2|EE286206

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211480625|gb|FL107338.1|FL107338

EST:     GTGGGATGGGACTGTCSATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGTTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGG
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGG

EST: gi|148930315|gb|EE284711.2|EE284711

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4388173|gb|AI491345.1|AI491345

EST:     ATTGGTNCAATGATCGCTGAATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: ATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|22521496|gb|BU080307.1|BU080307

EST:     GATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60340648|gb|DN207621.1|DN207621

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGTTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|22473321|gb|BU037801.1|BU037801

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACACGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAA
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACA-GTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAA

EST: gi|211255519|gb|FL452747.1|FL452747

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|78111778|gb|DV530175.1|DV530175

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|67024831|gb|CO453580.1|CO453580

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60396264|gb|DN229133.1|DN229133

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGTTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|22542071|gb|BU092509.1|BU092509

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|76017825|gb|DT944995.1|DT944995

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60400705|gb|DN233512.1|DN233512

EST:     GATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTAGTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|5058758|gb|AI737234.1|AI737234

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCCCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|29945859|gb|CB815856.1|CB815856

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|67021569|gb|CO450318.1|CO450318

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|149102540|gb|EE287897.2|EE287897

EST:     GGGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|78091577|gb|DV519951.1|DV519951

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|50325401|gb|CO520527.1|CO520527

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60396648|gb|DN229516.1|DN229516

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|61119780|gb|DN560741.1|DN560741

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211477744|gb|FL107320.1|FL107320

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|50325400|gb|CO520526.1|CO520526

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|88747941|gb|DY532082.1|DY532082

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|31355177|gb|CD439534.1|CD439534

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211492156|gb|FL107392.1|FL107392

EST:     GTGGGATGGGACTGKCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTG
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTG

EST: gi|22521291|gb|BU080102.1|BU080102

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60400195|gb|DN233002.1|DN233002

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGTTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|31352712|gb|CD437069.1|CD437069

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71305291|gb|DR788779.1|DR788779

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4647461|gb|AI622536.1|AI622536

EST:     GTGGGATGGGCCTGTCGATTGGTCCAATGATCCCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGCCAGTGAGGGTGCCCGGCTCGTGGGGACC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|120479865|gb|EH210655.1|EH210655

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|94476027|gb|EB704985.1|EB704985

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4647226|gb|AI622301.1|AI622301

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTCCAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGCCAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|18383566|gb|BM416766.1|BM416766

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTGCAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71435404|gb|DR816454.1|DR816454

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGG
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGG

EST: gi|148948646|gb|EC898560.2|EC898560

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|120480036|gb|EH210702.1|EH210702

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|101388656|gb|EB816314.1|EB816314

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|30032157|gb|CB834008.1|CB834008

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211489283|gb|FL107389.1|FL107389

EST:     GGGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTNGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGT
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGT

EST: gi|74245089|gb|DT653003.1|DT653003

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|149080432|gb|EE169456.2|EE169456

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGAGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|6952787|gb|AW424855.1|AW424855

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|40334395|gb|CK368465.1|CK368465

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32863699|gb|CF003381.1|CF003381

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|94472205|gb|EB701163.1|EB701163

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|88756374|gb|DY540515.1|DY540515

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211396655|gb|FL107314.1|FL107314

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGAGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|5058715|gb|AI737191.1|AI737191

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGCCAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211492165|gb|FL107401.1|FL107401

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCWGGTTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|26457642|gb|CA829225.1|CA829225

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|74239035|gb|DT646949.1|DT646949

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71328531|gb|DR800922.1|DR800922

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|31351554|gb|CD435911.1|CD435911

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60339639|gb|DN206612.1|DN206612

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|78120600|gb|DV538984.1|DV538984

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32807075|gb|CD959309.1|CD959309

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGACTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32827429|gb|CD967107.1|CD967107

EST:     GTGAGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|76293517|gb|DV033085.1|DV033085

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTATTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|31354511|gb|CD438868.1|CD438868

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|16925679|gb|BM078747.1|BM078747

EST:     TGGGATGGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: TGGGAT-GGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|78111766|gb|DV530163.1|DV530163

EST:     GTGAGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|149102541|gb|EE287898.2|EE287898

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|50338044|gb|CO533170.1|CO533170

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGNGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4775866|gb|AI664871.1|AI664871

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|22819801|gb|BU499891.1|BU499891

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60357179|gb|DN224152.1|DN224152

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32851229|gb|CD990910.1|CD990910

EST:     GGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211477741|gb|FL107317.1|FL107317

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211486402|gb|FL107374.1|FL107374

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71298844|gb|DR785411.1|DR785411

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4827480|gb|AI668172.1|AI668172

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|21625974|gb|BQ620895.1|BQ620895

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71305289|gb|DR788778.1|DR788778

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|19058235|gb|BM736902.1|BM736902

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGGACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32824775|gb|CD964497.1|CD964497

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|93283424|gb|EB675688.1|EB675688

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|40286958|gb|CK327350.1|CK327350

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|148948645|gb|EC898559.2|EC898559

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|213187803|gb|FM184192.1|FM184192

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGNGAGGGTGCGCGGCTCGTNNNGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|21331351|gb|BQ486732.1|BQ486732

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60356523|gb|DN223496.1|DN223496

EST:     GTGGGATGGGACTGTCAATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211486400|gb|FL107372.1|FL107372

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACCATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGGCT-GTACTATGTTGACAATGGAGG-TGCGCGGCTCGTGG
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGG-CTTGTACTATGTTGACAGTG-AGGGTGCGCGGCTCGTGG

EST: gi|22542600|gb|BU093038.1|BU093038

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGCCAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|45567510|gb|CK985606.1|CK985606

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71328533|gb|DR800923.1|DR800923

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|32827549|gb|CD967227.1|CD967227

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|76282580|gb|DV022148.1|DV022148

EST:     GGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71775191|gb|DR973069.1|DR973069

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71434177|gb|DR815227.1|DR815227

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|37375977|gb|CF624481.1|CF624481

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|101383043|gb|EB813574.1|EB813574

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4753476|gb|AI657386.1|AI657386

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|74235153|gb|DT643067.1|DT643067

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|16925847|gb|BM078915.1|BM078915

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATTAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|76293518|gb|DV033086.1|DV033086

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|211489280|gb|FL107386.1|FL107386

EST:     GKGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGKACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGG
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGG

EST: gi|60352355|gb|DN219328.1|DN219328

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGTTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60399148|gb|DN231962.1|DN231962

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|213171133|gb|FM189138.1|FM189138

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|67024666|gb|CO453415.1|CO453415

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|20803220|gb|BQ294270.1|BQ294270

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|74245088|gb|DT653002.1|DT653002

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|74234793|gb|DT642707.1|DT642707

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|71770949|gb|DR968886.1|DR968886

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|4573344|gb|AI586903.1|AI586903

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTCCAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCCCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|76282581|gb|DV022149.1|DV022149

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|9254778|gb|BE345246.1|BE345246

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|60354395|gb|DN221368.1|DN221368

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|74234792|gb|DT642706.1|DT642706

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|78120599|gb|DV538983.1|DV538983

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

EST: gi|149089315|gb|EE178536.2|EE178536

EST:     GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAG                         GGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC
genomic: GTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAAC

RNA-Seq data

ATGC Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

atgs Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.

Found data for 4 RNA-Seq libraries.

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1424

CTCTATTGCTGGTGCTTCCAAACTGTTGGCTAACATCCTTTATTCATATCGTGGGATGGGACTGTCGATTGGTACAATGATCGCTGGATGGGATGAGAAGgtgactcgtt ... cttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATG

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1034

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 760

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1416

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgcataatggctttcttttcttttttgaactttaatgattgttctcttgatctagGGTCCTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATG