1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagttgcctcttcaattacatgatttctgattgttattcttatcttattttttgttacttaaattatcatgtgtattttgatattggatttgcttagtatcttgtgtataaattgtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCACCAGGCACAGGTCGTTGTTTCAACTGTGGAATGGATGGTCACTGGGCAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G099317_T03 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|148934490|gb|EC878531.2|EC878531
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|76014888|gb|DT942058.1|DT942058
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|26558569|gb|CA830804.1|CA830804
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|71438768|gb|DR819818.1|DR819818
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|148934137|gb|EC878155.2|EC878155
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|74232122|gb|DT640036.1|DT640036
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|22491590|gb|BU051513.1|BU051513
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211248809|gb|FL007474.1|FL007474
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|149070621|gb|EE159032.2|EE159032
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211251027|gb|FL007476.1|FL007476
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCC-TCCAEST: gi|211251030|gb|FL007479.1|FL007479
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGEST: gi|19436214|gb|BM952624.1|BM952624
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGG
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211251028|gb|FL007477.1|FL007477
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|148959184|gb|EE010639.2|EE010639
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|71310802|gb|DR791706.1|DR791706
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|71438958|gb|DR820008.1|DR820008
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|71298912|gb|DR785451.1|DR785451
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211251031|gb|FL007480.1|FL007480
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|76282712|gb|DV022280.1|DV022280
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211251036|gb|FL007485.1|FL007485
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|29945034|gb|CB815435.1|CB815435
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|76280523|gb|DV020091.1|DV020091
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|50333687|gb|CO528813.1|CO528813
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|19351122|gb|BM895654.1|BM895654
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211248808|gb|FL007473.1|FL007473
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|211251029|gb|FL007478.1|FL007478
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|50336824|gb|CO531950.1|CO531950
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|76289551|gb|DV029119.1|DV029119
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|71771421|gb|DR969358.1|DR969358
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|148941832|gb|EC886805.2|EC886805
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|87153453|gb|DY398242.1|DY398242
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|89251320|gb|DY623106.1|DY623106
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|23357517|gb|BU645166.1|BU645166
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|87155664|gb|DY400453.1|DY400453
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|31406034|gb|CD484766.1|CD484766
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|149108516|gb|EE292817.2|EE292817
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: TGGCAGGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAEST: gi|37425051|gb|CF650261.1|CF650261
genomic: TGGCAGGG-ATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
tgtgtattttgatattggatttgcttagtatcttgtgtataaattgtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCACCAGGCACAGGTCGTTGTTTCAACTGTGGAATGGATGGTCACTGGGCAA
ttttgat putative branch site (score: 4)
attttgatatt TA-rich tract