1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagttgcctcttcaattacatgatttctgattgttattcttatcttattttttgttacttaaattatcatgtgtattttgatattggatttgcttagtatcttgtgtataaattgtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCACCAGGCACAGGTCGTTGTTTCAACTGTGGAATGGATGGTCACTGGGCAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G099317_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCAEST: gi|148954856|gb|EC900331.2|EC900331
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
EST: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGG GTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
genomic: ATGGCAGGGATGTCGATGGAAGTCGCATTGTTGTTGAGTTTGCTAAAGGGgtaagttgcc ... gtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCA
tgtgtattttgatattggatttgcttagtatcttgtgtataaattgtgcttgcagGTCCCACGTGGTCCAGGTGGCTCACGTGAATATATGGGAAGAGGCCCTCCACCAGGCACAGGTCGTTGTTTCAACTGTGGAATGGATGGTCACTGGGCAA
ttttgat putative branch site (score: 4)
attttgatatt TA-rich tract