1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaagctccctgtttgcactctgaatgttcagatgagcctacaaagaaagaaccaacaaatgtttatctgctttagaccgaactaggatcaatagcacacagagattctttggaatatctgttctgttgaaatgttgggcgactagttctgactcctgaacaatgttaacctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTTTCTAAAGGACGGGGTCAACGACCGCACAGACAAATACGGTGGCAGTCT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G087192_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|33098560|gb|CF058520.1|CF058520
genomic: GAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|76017394|gb|DT944564.1|DT944564
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: ATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTGGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|60397054|gb|DN229873.1|DN229873
genomic: ATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|33098710|gb|CF058670.1|CF058670
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|33099068|gb|CF059028.1|CF059028
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|86474314|gb|DY240684.1|DY240684
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|32828310|gb|CD967988.1|CD967988
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|32844951|gb|CD984632.1|CD984632
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|71766717|gb|DR964654.1|DR964654
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|78110280|gb|DV528695.1|DV528695
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|13382053|gb|BG458728.1|BG458728
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|33099221|gb|CF059181.1|CF059181
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|71769744|gb|DR967681.1|DR967681
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|16927662|gb|BM080731.1|BM080731
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: AATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|71448418|gb|DR829468.1|DR829468
genomic: AATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|31363471|gb|CD447828.1|CD447828
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|32844217|gb|CD983898.1|CD983898
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|32845504|gb|CD985185.1|CD985185
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGGTTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|76017395|gb|DT944565.1|DT944565
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|71431905|gb|DR812955.1|DR812955
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|13382062|gb|BG458737.1|BG458737
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|33099127|gb|CF059087.1|CF059087
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTEST: gi|76281886|gb|DV021454.1|DV021454
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGT
EST: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTG GATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGAT
genomic: TTTGGTCGTCAATGATTTCAGGGTAGCTGCTCGAAATGCGATTGAAGCTGgtaagctccc ... ctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGAT
gttgaaatgttgggcgactagttctgactcctgaacaatgttaacctgcatgtagGATTTGATGGTGTCGAAATCCATGGAGCTCACGGTTACCTGATTGATCAGTTTCTAAAGGACGGGGTCAACGACCGCACAGACAAATACGGTGGCAGTCT
tgttaac putative branch site (score: 218)
aatgttaa TA-rich tract