1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...ttatcaacatgtagccatcgcctacacctacatgccaagacacggtggaatctagcatattttacttggcagttgataacatgacaaatttacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTCCGTCGCTTTGGATCTGTAAAGCACAGTGGTTTTGGGTTGGGTTTTGAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G083836_T02 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|8368904|gb|BE051849.1|BE051849
genomic: CTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|7227809|gb|AW566450.1|AW566450
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: AAGCCAAAGGGAGGATCGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|213171245|gb|FM192549.1|FM192549
genomic: AAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|6653859|gb|AW267264.1|AW267264
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|32935917|gb|CF040729.1|CF040729
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|19769665|gb|BQ034386.1|BQ034386
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCCAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|211129628|gb|FL442090.1|FL442090
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTEST: gi|5608055|gb|AI901722.1|AI901722
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
EST: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAG GATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
genomic: TTGATTGGTGGAAGCCAAAGGGAGGAACGGTTAGATGTTCTGAAACAGAGgtatgtgcta ... tacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCT
tggaatctagcatattttacttggcagttgataacatgacaaatttacttggcagGATACTTGATGCTGGCCTGCCTTTGGAACCCTATGAATGGTACTTGGACCTCCGTCGCTTTGGATCTGTAAAGCACAGTGGTTTTGGGTTGGGTTTTGAA
tgataac putative branch site (score: 118)
tttactt putative PPT
atattttactt TA-rich tract