1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
...ttgagtggttcaaacaaattgtttttgctagtgagtgggtaattaacatgataacaaagttgttttttggttcacatttttctcattacttttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAGTGTATGCACACCCATCTATGGCCTCG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G074373_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|211035651|gb|FK982762.1|FK982762
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|8367371|gb|BE050316.1|BE050316
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGEST: gi|71318161|gb|DR795843.1|DR795843
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATG
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|78090597|gb|DV518971.1|DV518971
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|148976204|gb|EE025907.2|EE025907
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: -CCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGEST: gi|148963993|gb|EE015131.2|EE015131
genomic: ACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCC-TTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCC-TATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGG
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|148930175|gb|EC872560.2|EC872560
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|71439024|gb|DR820074.1|DR820074
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAEST: gi|71426949|gb|DR807999.1|DR807999
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
EST: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAG CCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
genomic: CACCTGTGGCATCAAGTCCACAGGGTCATCCTTACATGTGGGGAGCTCAGgtaagctttt ... tttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGA
acatgataacaaagttgttttttggttcacatttttctcattacttttttttcagCCTATGATTCCACCATATGGAGCACCGCCATATGTCATGTACCCTCCTGGAGTGTATGCACACCCATCTATGGCCTCG
tgataac putative branch site (score: 71)
ttcacatttttctcat putative PPT
atttttctcattactt TA-rich tract