Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tctggtcaatttccctagttcatctaaataaaattttcaggcagattttaccattcatttgagctggacactaacaaaaaaaattgttatccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGGACTGTTTATCTACCTTGTCGCGAGCCCGTCGAAGAGCAGCTCAAAGGCAA

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G067476_T02
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G067476_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os01g01307.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
tctggtcaatttccctagttcatctaaataaaattttcaggcagattttaccattcatttgagctggacactaacaaaaaaaattgttatccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGGACTGTTTATCTACCTTGTCGCGAGCCCGTCGAAG---AGCAGCTCAAAGGCAA
    || ||||| |    ||  | | | |  |        |||  ||||    | ||| |  | | ||    |  |   | ||   |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||||    || |||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||    ||| |  |||| |   
----gtaaatttactc--tttgttttattcta--caaggagcaacttttctagtgcatctatggtagaagaaattactgagaa--attatccatttgcagAGGCTTGTGGCGAAGTACGGGTCGCTGGTGTCCGTTGTTGGCTTGGTTGGAGTGTTTATCTACCTGGTTGCAAGCCCGTCAAAATCCAGCGGTGCAAAAG---
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|18163508|gb|BM333347.1|BM333347
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18163508|gb|BM333347.1|BM333347
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17929925|gb|BM266885.1|BM266885
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17929925|gb|BM266885.1|BM266885
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18173129|gb|BM348517.1|BM348517
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18173129|gb|BM348517.1|BM348517
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18162749|gb|BM332588.1|BM332588
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18162749|gb|BM332588.1|BM332588
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18164000|gb|BM333839.1|BM333839
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18164000|gb|BM333839.1|BM333839
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18167113|gb|BM336952.1|BM336952
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18167113|gb|BM336952.1|BM336952
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17932024|gb|BM268984.1|BM268984
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17932024|gb|BM268984.1|BM268984
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18176508|gb|BM351441.1|BM351441
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18176508|gb|BM351441.1|BM351441
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18168815|gb|BM338655.1|BM338655
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18168815|gb|BM338655.1|BM338655
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|15053687|gb|BI359232.1|BI359232
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|15053687|gb|BI359232.1|BI359232
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18161892|gb|BM331731.1|BM331731
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18161892|gb|BM331731.1|BM331731
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78026101|gb|DV494488.1|DV494488
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78026101|gb|DV494488.1|DV494488
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18168234|gb|BM338074.1|BM338074
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18168234|gb|BM338074.1|BM338074
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|148963283|gb|EE014273.2|EE014273
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|148963283|gb|EE014273.2|EE014273
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17931731|gb|BM268691.1|BM268691
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17931731|gb|BM268691.1|BM268691
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|16926595|gb|BM079663.1|BM079663
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|16926595|gb|BM079663.1|BM079663
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18173140|gb|BM348528.1|BM348528
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18173140|gb|BM348528.1|BM348528
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|16378806|gb|BI992621.1|BI992621
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|16378806|gb|BI992621.1|BI992621
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|37391749|gb|CF633118.1|CF633118
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|37391749|gb|CF633118.1|CF633118
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18165958|gb|BM335797.1|BM335797
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18165958|gb|BM335797.1|BM335797
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|15053686|gb|BI359231.1|BI359231
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|15053686|gb|BI359231.1|BI359231
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|148973350|gb|EE024440.2|EE024440
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTTTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|148973350|gb|EE024440.2|EE024440
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTTTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18173671|gb|BM349059.1|BM349059
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18173671|gb|BM349059.1|BM349059
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|7135836|gb|AW498291.1|AW498291
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|7135836|gb|AW498291.1|AW498291
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17930017|gb|BM266977.1|BM266977
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17930017|gb|BM266977.1|BM266977
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18181378|gb|BM382588.1|BM382588
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18181378|gb|BM382588.1|BM382588
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78105566|gb|DV523984.1|DV523984
EST:     AGAGAAGAAGTTTGATTGGGTTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTGGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78105566|gb|DV523984.1|DV523984
EST:     AGAGAAGAAGTTTGATTGGGTTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTGGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18167604|gb|BM337444.1|BM337444
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18167604|gb|BM337444.1|BM337444
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18174175|gb|BM349563.1|BM349563
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18174175|gb|BM349563.1|BM349563
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18174386|gb|BM349774.1|BM349774
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18174386|gb|BM349774.1|BM349774
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|6742602|gb|AW313417.1|AW313417
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|6742602|gb|AW313417.1|AW313417
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18162934|gb|BM332773.1|BM332773
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18162934|gb|BM332773.1|BM332773
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|14244099|gb|BG841759.2|BG841759
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|14244099|gb|BG841759.2|BG841759
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|22819811|gb|BU499901.1|BU499901
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|22819811|gb|BU499901.1|BU499901
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18172051|gb|BM347439.1|BM347439
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18172051|gb|BM347439.1|BM347439
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17930674|gb|BM267634.1|BM267634
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|17930674|gb|BM267634.1|BM267634
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78081514|gb|DV509926.1|DV509926
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78081514|gb|DV509926.1|DV509926
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|211489309|gb|FL450049.1|FL450049
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|211489309|gb|FL450049.1|FL450049
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|50331163|gb|CO526289.1|CO526289
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|50331163|gb|CO526289.1|CO526289
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|5108408|gb|AI740121.1|AI740121
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|5108408|gb|AI740121.1|AI740121
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18171008|gb|BM340848.1|BM340848
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18171008|gb|BM340848.1|BM340848
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|50334314|gb|CO529440.1|CO529440
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|50334314|gb|CO529440.1|CO529440
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|60400336|gb|DN233143.1|DN233143
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|60400336|gb|DN233143.1|DN233143
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18171772|gb|BM341612.1|BM341612
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18171772|gb|BM341612.1|BM341612
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|51592511|gb|CV071657.1|CV071657
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|51592511|gb|CV071657.1|CV071657
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78081882|gb|DV510294.1|DV510294
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|78081882|gb|DV510294.1|DV510294
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|89249775|gb|DY621561.1|DY621561
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|89249775|gb|DY621561.1|DY621561
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|28986044|gb|CB350941.1|CB350941
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|28986044|gb|CB350941.1|CB350941
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|15426866|gb|BI542688.1|BI542688
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|15426866|gb|BI542688.1|BI542688
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18176005|gb|BM351115.1|BM351115
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18176005|gb|BM351115.1|BM351115
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18172256|gb|BM347644.1|BM347644
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18172256|gb|BM347644.1|BM347644
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18172871|gb|BM348259.1|BM348259
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18172871|gb|BM348259.1|BM348259
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|31357834|gb|CD442191.1|CD442191
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|31357834|gb|CD442191.1|CD442191
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|28985718|gb|CB350781.1|CB350781
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|28985718|gb|CB350781.1|CB350781
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|110524573|gb|EE028757.1|EE028757
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCCCTTGTGTCTGTTGTTTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|110524573|gb|EE028757.1|EE028757
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCCCTTGTGTCTGTTGTTTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|32859855|gb|CD999536.1|CD999536
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|32859855|gb|CD999536.1|CD999536
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18168659|gb|BM338499.1|BM338499
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18168659|gb|BM338499.1|BM338499
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18170719|gb|BM340559.1|BM340559
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18170719|gb|BM340559.1|BM340559
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|101397131|gb|EB820489.1|EB820489
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGTTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|101397131|gb|EB820489.1|EB820489
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGTTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18163404|gb|BM333243.1|BM333243
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
EST: gi|18163404|gb|BM333243.1|BM333243
EST:     AGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG                         AGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG
genomic: AGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAA-gtaagcatgc ... ccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttttaccattcatttgagctggacactaacaaaaaaaattgttatccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGGACTGTTTATCTACCTTGTCGCGAGCCCGTCGAAGAGCAGCTCAAAGGCAA
                       cactaac  putative branch site (score: 1)
                        actaacaaaaaaaatt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tctggtcaatttccctagttcatctaaataaaattttcaggcagattttaccattcatttgagctggacactaacaaaaaaaattgttatccatgtgcagAGGCTTGTGATGAAATACGGGTCACTTGTGTCTGTTGTCTCTTTTGTTGGACTGTTTATCTACCTTGTCGCGAGCCCGTCGAAGAGCAGCTCAAAGGCAA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTCA