1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtgggtagtggtagaattgcattctatcttgatatgcatgtgctagaagaggtgtttaatatatttacatttttcatatcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAGATATTAAGCCTCAGAATATCTTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G043350_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|71446526|gb|DR827576.1|DR827576
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|148944449|gb|EC889564.2|EC889564
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|148952374|gb|EC898188.2|EC898188
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|71438041|gb|DR819091.1|DR819091
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|78092425|gb|DV520799.1|DV520799
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|71434429|gb|DR815479.1|DR815479
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: CATGAAGCAGAGGATGCCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGTTTATTTTCATACTGTACCAGGAATTTGTCAEST: gi|50322397|gb|CO517523.1|CO517523
genomic: CATGAAGCAGAGGATGCCCC-TTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|149083957|gb|EE173340.2|EE173340
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|31355327|gb|CD439684.1|CD439684
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGTGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|91055941|gb|EB166359.1|EB166359
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|149076229|gb|EE164829.2|EE164829
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|149112100|gb|EE295033.2|EE295033
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAEST: gi|6021078|gb|AW066006.1|AW066006
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTEST: gi|149101575|gb|EE187701.2|EE187701
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACT
EST: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAG ATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
genomic: ACATGAAGCAGAGGATGCCCCTTATATATGTTAAATTGTATATGTACCAGgtgggtagtg ... tcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGA
atgcatgtgctagaagaggtgtttaatatatttacatttttcatatcttgtgcagATATTCCGGGGACTAGCTTATATTCATACTGTACCAGGAATTTGTCACCGAGATATTAAGCCTCAGAATATCTTG
gtttaat putative branch site (score: 77)
tgtttaatatatttac TA-rich tract