1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtatgctgatccccttacatacagtattagtgtgtttaataattaggctcatgcatttctgttcatgttgaattctgattggtgtttactgttcttttttggtaaaaagCTAGCTTCAATGGAATCGGTCCGTGGAGTTAATGTTCCTATGTATACAACTCTACGGCGCACGACAGTTGTGTTTACAATGACAATGGAGTATTTCCTGG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G133226_T03 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGTTATTACTACGCACCACACCTCTTTCCTTGGCTTATTTACTCTACATG CT---T-CAATGGAATCGGTCCGTGGAGTTAATGTTCCTATGTATACAACTEST: gi|91054599|gb|EB165017.1|EB165017
genomic: G-TTATTACTACGCACCACACCTCTTTCCTTGGCTTATTTACTCTACATGgtatgctgat ... tggtaaaaagCTAGCTTCAATGGAATCGGTCCGTGGAGTTAATGTTCCTATGTATACAACT
EST: GTTATTACTACGCACCACACCTCTTTCCTTGGCTTATTTACTCTACATG CTAGCTTCAATGGAATCGGTCCGTGGAGTTAATGTTCCTATGTATACAACT
genomic: GTTATTACTACGCACCACACCTCTTTCCTTGGCTTATTTACTCTACATGgtatgctgat ... tggtaaaaagCTAGCTTCAATGGAATCGGTCCGTGGAGTTAATGTTCCTATGTATACAACT
atttctgttcatgttgaattctgattggtgtttactgttcttttttggtaaaaagCTAGCTTCAATGGAATCGGTCCGTGGAGTTAATGTTCCTATGTATACAACTCTACGGCGCACGACAGTTGTGTTTACAATGACAATGGAGTATTTCCTGG
ttctgat putative branch site (score: 3)
tttactgttctttttt putative PPT
ttttttggtaaaaa TA-rich tract