1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaggctgggagtcgcttgttttagcatgttgccttttacatggtatttctcttactgcccattccttgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAAGGGTCTTGATGTCATTCAGCAAGCACAATCTGGTACAGGAAAGACAGC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G116034_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|19351508|gb|BM896040.1|BM896040
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149057504|gb|EE156642.2|EE156642
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211317180|gb|FL039359.1|FL039359
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211292598|gb|FL286205.1|FL286205
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|87151961|gb|DY396750.1|DY396750
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211294745|gb|FL286225.1|FL286225
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|148931048|gb|EC873642.2|EC873642
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211319193|gb|FL039360.1|FL039360
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|5555520|gb|AI881471.1|AI881471
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149086608|gb|EE176151.2|EE176151
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211074058|gb|FL286105.1|FL286105
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|148944140|gb|EC889228.2|EC889228
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|148978929|gb|EE026387.2|EE026387
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211085019|gb|FL286163.1|FL286163
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|31558561|gb|CD527773.1|CD527773
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|78114933|gb|DV533321.1|DV533321
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149071683|gb|EE160076.2|EE160076
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149112482|gb|EE295354.2|EE295354
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|31349869|gb|CD434226.1|CD434226
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|21809790|gb|BQ668108.1|BQ668108
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|31363551|gb|CD447908.1|CD447908
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211071319|gb|FL286089.1|FL286089
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|31355862|gb|CD440219.1|CD440219
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211076799|gb|FL286117.1|FL286117
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211085027|gb|FL286171.1|FL286171
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTWCCCTTCTGCAEST: gi|31360434|gb|CD444791.1|CD444791
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149109326|gb|EE190140.2|EE190140
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|13382120|gb|BG458795.1|BG458795
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211292606|gb|FL286213.1|FL286213
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|13125989|gb|BG316664.1|BG316664
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211290463|gb|FL286196.1|FL286196
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|19351431|gb|BM895948.1|BM895948
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211288324|gb|FL286184.1|FL286184
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211085017|gb|FL286161.1|FL286161
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149075721|gb|EE164266.2|EE164266
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211082283|gb|FL286152.1|FL286152
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|6636979|gb|AW261251.1|AW261251
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|71768076|gb|DR966013.1|DR966013
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|148953344|gb|EE152835.2|EE152835
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211288327|gb|FL286187.1|FL286187
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211076806|gb|FL286124.1|FL286124
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149023519|gb|EE045864.2|EE045864
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|29947480|gb|CB816678.1|CB816678
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|149097051|gb|EE182858.2|EE182858
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAEST: gi|211319197|gb|FL039364.1|FL039364
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
EST: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATG GTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
genomic: TGATGATATGGGCCTCCAAGAGAATCTTCTGAGAGGCATTTATGCTTATGgtaggctggg ... tgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCA
tagcatgttgccttttacatggtatttctcttactgcccattccttgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAAGGGTCTTGATGTCATTCAGCAAGCACAATCTGGTACAGGAAAGACAGC
ctcttac putative branch site (score: 3)
tttctcttactgccca CT-rich tract
ttttacat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtaggctgggagtcgcttgttttagcatgttgccttttacatggtatttctcttactgcccattccttgtggtgtagGTTTTGAGAAGCCATCTGCAATTCAGCAGAGAGGAATTGTTCCCTTCTGCAAGGGTCTTGATGTCATTCAGCAAGCACAATCTGGTACAGGAAAGACAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCAAG