1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaagtattgtggtgtactactgtcaatatggatttctagttttctttctaacgtaatcgtttatggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGTACGTGCGGGGTAATAATGTTCAATGCAAAACCAGCCATGGTTAGTGGT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G108919_T06 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|50329632|gb|CO524758.1|CO524758
genomic: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGGgtaagtattg ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATATGGAGCCCCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCEST: gi|6563947|gb|AW231569.1|AW231569
genomic: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGGgtaagtattg ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGC
EST: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|89247954|gb|DY619740.1|DY619740
genomic: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGGgtaagtattg ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTTTGAAGEST: gi|32859080|gb|CD998761.1|CD998761
genomic: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGGgtaagtattg ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
genomic: TACCCTTATAGATCATATGGAGCACCGTACTTCCCCCCATACGGTTATGGgtaagtattg ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
ctgtcaatatggatttctagttttctttctaacgtaatcgtttatggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGTACGTGCGGGGTAATAATGTTCAATGCAAAACCAGCCATGGTTAGTGGT
ttctaac putative branch site (score: 1)
ttttcttt TA-rich tract