1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaagtaccctattctttttgtaacaaatcatgttactgaattatatgacattaccgcttaatgttttccttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCACTATCCAATGCTAGCATATTTTGCCATTGCTGAGAATGAATCGATCGGA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G106574_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|14243476|gb|BG841204.2|BG841204
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|76912105|gb|DV164577.1|DV164577
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|4730361|gb|AI649527.1|AI649527
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32846502|gb|CD986183.1|CD986183
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: ACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|213169581|gb|FM186027.1|FM186027
genomic: ACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32855389|gb|CD995070.1|CD995070
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32809049|gb|CD961283.1|CD961283
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|33285604|gb|CF075399.1|CF075399
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|60338673|gb|DN205646.1|DN205646
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32806541|gb|CD958775.1|CD958775
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|60358045|gb|DN225018.1|DN225018
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|37391857|gb|CF633173.1|CF633173
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|15080579|gb|BI389110.1|BI389110
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32907954|gb|CF012767.1|CF012767
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|116819876|gb|EC863043.1|EC863043
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|213179135|gb|FM184923.1|FM184923
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|116829615|gb|EC870229.1|EC870229
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGCCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|211218119|gb|FL199938.1|FL199938
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|116824059|gb|EC867648.1|EC867648
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|211218118|gb|FL199937.1|FL199937
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32807783|gb|CD960017.1|CD960017
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|32932016|gb|CF036828.1|CF036828
genomic: CATCTTCAAGCCAAATATGTTGGTACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: ACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCAEST: gi|33095589|gb|CF055583.1|CF055583
genomic: ACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
EST: ACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATT TGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
genomic: ACAGGGCATGCTGATTTGTCTAGATTgtaagtaccc ... ttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCA
aaatcatgttactgaattatatgacattaccgcttaatgttttccttatttacagTGAATGGGCTGTAAACATCCAGAGAGACAGCTATGCCTCTTATATTGGGCACTATCCAATGCTAGCATATTTTGCCATTGCTGAGAATGAATCGATCGGA
gcttaat putative branch site (score: 502)
tgttttccttattt CT-rich tract
aattatatgacatta TA-rich tract