Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatacattttgctttattaataatctttcagaacaattcttattaaagcatttaagtttgacacaagtacataatcagtcaaaatctgaagcttagttttccacaataaacaccttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCTCCTAGGTGTGGTTTCAGTGCATTAGCAGTGAAGGTCCTCCAGCAATATG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G080722_T01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6587608|gb|AW244926.1|AW244926
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|71772931|gb|DR970854.1|DR970854
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211393122|gb|FK956090.1|FK956090
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|149072625|gb|EE160853.2|EE160853
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395748|gb|FK956105.1|FK956105
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211393118|gb|FK956086.1|FK956086
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|84980246|gb|DW530595.1|DW530595
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|32908833|gb|CF013646.1|CF013646
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|116818678|gb|EC861726.1|EC861726
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395745|gb|FK956102.1|FK956102
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTA
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTA
EST: gi|211393125|gb|FK956093.1|FK956093
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211393120|gb|FK956088.1|FK956088
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211137287|gb|FL122274.1|FL122274
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|76019176|gb|DT946346.1|DT946346
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211138215|gb|FL122278.1|FL122278
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|31348993|gb|CD433350.1|CD433350
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395746|gb|FK956103.1|FK956103
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211393121|gb|FK956089.1|FK956089
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|149076048|gb|EE164622.2|EE164622
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211208256|gb|FL334762.1|FL334762
EST:     CAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: CAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395743|gb|FK956100.1|FK956100
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|71772930|gb|DR970853.1|DR970853
EST:     AGCCACCAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211393127|gb|FK956095.1|FK956095
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211393123|gb|FK956091.1|FK956091
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACC-TGTTGTCATCTATATGAA
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAA
EST: gi|149072626|gb|EE160854.2|EE160854
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|76019175|gb|DT946345.1|DT946345
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211138212|gb|FL122275.1|FL122275
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|31364491|gb|CD448846.1|CD448846
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395741|gb|FK956098.1|FK956098
EST:     GCCAACAAGTAAAAGTGTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: GCCAACAAGTAAAAGT-TCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211215605|gb|FL316840.1|FL316840
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGCTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGC
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTG-TTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGC
EST: gi|211138213|gb|FL122276.1|FL122276
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395742|gb|FK956099.1|FK956099
EST:     AGCCAACAAGYAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACC-TGTTGTCATCTACATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|6020541|gb|AW065469.1|AW065469
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|71771232|gb|DR969169.1|DR969169
EST:     CAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: CAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395740|gb|FK956097.1|FK956097
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGACGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211138218|gb|FL122281.1|FL122281
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395752|gb|FK956109.1|FK956109
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|32908771|gb|CF013584.1|CF013584
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|32908664|gb|CF013477.1|CF013477
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|149051827|gb|EE155954.2|EE155954
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211138219|gb|FL122282.1|FL122282
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211395747|gb|FK956104.1|FK956104
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTATCCTGATGCT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCT
EST: gi|211138216|gb|FL122279.1|FL122279
EST:     AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAG                         GATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAGGGTTAT
genomic: AGCCAACAAGTAAAAGTTCAGATATGTCTTTCAGTGACATTGTTGCTCAGgtatacattt ... accttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTAT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtacataatcagtcaaaatctgaagcttagttttccacaataaacaccttggcagGATGTGAAGGAGCACCCTGTTGTCATCTATATGAAAGGTTATCCTGATGCTCCTAGGTGTGGTTTCAGTGCATTAGCAGTGAAGGTCCTCCAGCAATATG
                          ttagtttt  TA-rich tract