1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...tttattctatcatatgttggtaattccagcaggcagcaggcactactctttggatccacgtgacttgacaaagaaatcatgccatctttccacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTCTTAGCAGCCGTCCTGCTGGGAGAGTAAATGCAAGTTCAATTGATAACA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G067299_T02 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTEST: gi|149107346|gb|EE189225.2|EE189225
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTEST: gi|78112747|gb|DV531141.1|DV531141
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTEST: gi|149086246|gb|EE175786.2|EE175786
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTEST: gi|149079157|gb|EE168093.2|EE168093
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGTGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCCGTGTACGTGTTTEST: gi|71317285|gb|DR795328.1|DR795328
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCC-GTGTACGTGTTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTEST: gi|94477323|gb|EB706281.1|EB706281
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCTAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTEST: gi|71772065|gb|DR970002.1|DR970002
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
EST: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGG GTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
genomic: CAGTGCATGTTATGAGCCAACACCTGGGTGCCAATCATGTCGATGGTGGGgtatggttca ... cacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTT
ctctttggatccacgtgacttgacaaagaaatcatgccatctttccacaatgcagGTCCGTGTACGTGTTTCTAGGGATTTTCTGGAGCTTGTCGAAAAGAATGTTCTTAGCAGCCGTCCTGCTGGGAGAGTAAATGCAAGTTCAATTGATAACA
acttgac putative branch site (score: 49)
ccatctttcc putative PPT
aaagaaat TA-rich tract