1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtactgcacaccattttttgttttgttatggttatcactggaacattttttaataccccattacttagccctgccgctcttctttgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGCCGGTGCCCAGAGTTCTGTCTTGCAACTGAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G060564_T03 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|149095487|gb|EE181140.2|EE181140
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|37416319|gb|CF645810.1|CF645810
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGCACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGEST: gi|211520841|gb|FL034048.1|FL034048
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGEST: gi|76284637|gb|DV024205.1|DV024205
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211520834|gb|FL034041.1|FL034041
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|71330287|gb|DR801905.1|DR801905
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|71768464|gb|DR966401.1|DR966401
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211520840|gb|FL034047.1|FL034047
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAEST: gi|211397639|gb|FL034039.1|FL034039
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCA
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGASEST: gi|211397637|gb|FL034037.1|FL034037
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|74245152|gb|DT653066.1|DT653066
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|149089290|gb|EE178503.2|EE178503
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|74234235|gb|DT642149.1|DT642149
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|71449020|gb|DR830070.1|DR830070
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|26456824|gb|CA828407.1|CA828407
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|71321160|gb|DR797280.1|DR797280
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|20512803|gb|BQ280001.1|BQ280001
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|148949975|gb|EC895492.2|EC895492
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|71315575|gb|DR794393.1|DR794393
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211520833|gb|FL034040.1|FL034040
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|78107038|gb|DV525456.1|DV525456
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|50337111|gb|CO532237.1|CO532237
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211397638|gb|FL034038.1|FL034038
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGASEST: gi|211520838|gb|FL034045.1|FL034045
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211520842|gb|FL034049.1|FL034049
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGEST: gi|71447386|gb|DR828436.1|DR828436
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|76014988|gb|DT942158.1|DT942158
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|78090964|gb|DV519338.1|DV519338
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACCTGCCATGCAGTGCAAAGTGTGGCCAGAGEST: gi|71311330|gb|DR791989.1|DR791989
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211520835|gb|FL034042.1|FL034042
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|101399172|gb|EB821460.1|EB821460
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|148937865|gb|EC882083.2|EC882083
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|101396680|gb|EB820265.1|EB820265
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACGTGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGACAAG ATATGTCTGTTGCGCTTGGCTACATGCCATGCAGTGGACAGTGTGGCGAGAEST: gi|211520837|gb|FL034044.1|FL034044
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCT-GGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGA
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|76011810|gb|DT938980.1|DT938980
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|71312763|gb|DR792909.1|DR792909
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|148953515|gb|EE153023.2|EE153023
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|78078643|gb|DV507055.1|DV507055
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|211520839|gb|FL034046.1|FL034046
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|91048377|gb|EB158795.1|EB158795
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|148930645|gb|EC872835.2|EC872835
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGEST: gi|50336576|gb|CO531702.1|CO531702
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
EST: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAG ATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
genomic: TGCGTGTCGTACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTCTACAATGACATGTCAAGgtactgcaca ... tgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAG
ggaacattttttaataccccattacttagccctgccgctcttctttgtgatgtagATATGTCTGTTGCGCTGGCTACATGCCATGCAGTGGAAAGTGTGGCGAGAGCCGGTGCCCAGAGTTCTGTCTTGCAACTGAG
ttttaat putative branch site (score: 3)
ccctgccgctcttctt putative PPT
attttttaata TA-rich tract