1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtaaagggaaatgtttgtattatgcctgtcctttgtgcttgcctccttccactatttcatttgattgtaaccaatttgtcaaatgcagAAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATGCTAGCCAAGATATTTTCTATTCG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G056573_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAATGTTTTCGTTCCTGCTACTGCAAATCCCTACCAATATGGCTATACAG AAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATGEST: gi|211122282|gb|FL031386.1|FL031386
genomic: AAATGTTTTCGTTCCTGCTACTGCAAATCCCTACCAATATGGCTATACAGgtaaagggaa ... tcaaatgcagAAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATG
EST: AAATGTTTTCGTTCCTGCTACTGCAAATCCCTACCAATATGGCTATACAG AAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATGEST: gi|211409691|gb|FL229014.1|FL229014
genomic: AAATGTTTTCGTTCCTGCTACTGCAAATCCCTACCAATATGGCTATACAGgtaaagggaa ... tcaaatgcagAAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATG
EST: AAATGTTTTCGTTCCTGCTACTGCAAATCCCTACCAATATGGCTATACAG AAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATG
genomic: AAATGTTTTCGTTCCTGCTACTGCAAATCCCTACCAATATGGCTATACAGgtaaagggaa ... tcaaatgcagAAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATG
tgtgcttgcctccttccactatttcatttgattgtaaccaatttgtcaaatgcagAAGTTGGATCACCAATGGAATGGTATAGTCACCCGAACTCTTCAGGATATGCTAGCCAAGATATTTTCTATTCG
ttgtaac putative branch site (score: 115)
tatttcatttgatt TA-rich tract