Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgggttattttggaataatattagtagtgttcaggttactcatttgcttttgctttacatctttccatgttttgagcatatcctctaatccttaaggtctatcttatgtcttgcagtagctgatagtgatgttgtcctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGAAGGGTGTCTCCAAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G048371_T01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os10g08550.5 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
gtgggttattttggaataatattagtagtgttcaggttactcatttgcttttgctttacatctttccatgttttgagcatatcctctaatccttaaggtctatcttatgtcttgcagtagctgatagtgatgttgtcctg-tttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGAAGGGTGTCTCCAAG
                        ||  | |  | |||  |  |||   |||| ||| |   |  ||||| |||   || ||  ||| |        |  |||  | || ||   || |||| ||        | || |  | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||
------------------------gttatttagatgttcttttttttgctttg-tttgctcataaccatggttt---cacattatcttaaatgatgtgattatggtttggct---agaagctaatctcatctctttcataatctacagGTGTCTATGAAGCTCTCGAATTGAGGGACGGTGGATCTGATTACTTGGGAAAGGGTGTTTCCAAG

upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os10g08550.3 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
gtgggttattttggaataatattagtagtgttcaggttactcatttgcttttgctttacatctttccatgttttgagcatatcctctaatccttaaggtctatcttatgtcttgcagtagctgatagtgatgttgtcctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGAAGGGTGTCTCCAAG
||||||||||| |  ||  | ||  |  || |  | || |||||   |  | | || ||||  |   |  |  || |  |||  | |    ||  | |   |||| || |||| ||  |                     | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||
gtgggttatttag--atgttcttttttttgctttgtttgctcata-accatggtttcacattatcttaaatgatgtgattatggtttgg--ctagaagctaatctcatctctttcataa---------------------tctacagGTGTCTATGAAGCTCTCGAATTGAGGGACGGTGGATCTGATTACTTGGGAAAGGGTGTTTCCAAG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|67016579|gb|CO445328.1|CO445328
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|5555521|gb|AI881472.1|AI881472
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|18649891|gb|BM498710.1|BM498710
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429978|gb|FK988665.1|FK988665
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435188|gb|FK988698.1|FK988698
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|30031961|gb|CB833812.1|CB833812
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|60340424|gb|DN207397.1|DN207397
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|29130133|gb|CB380837.1|CB380837
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432588|gb|FK988689.1|FK988689
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67011307|gb|CO440056.1|CO440056
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432592|gb|FK988693.1|FK988693
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|33095703|gb|CF055697.1|CF055697
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATCTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|29130740|gb|CB381444.1|CB381444
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|33095727|gb|CF055721.1|CF055721
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|22491087|gb|BU051010.1|BU051010
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|6626439|gb|AW257971.1|AW257971
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435197|gb|FK988707.1|FK988707
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432587|gb|FK988688.1|FK988688
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432581|gb|FK988682.1|FK988682
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTRGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|22489635|gb|BU049558.1|BU049558
EST:     GAGCATCAACTG                         G-GTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: GAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|18384419|gb|BM417618.1|BM417618
EST:     CTCAGATGGAACC-TTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         G-GTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211437781|gb|FK988709.1|FK988709
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|76294188|gb|DV033756.1|DV033756
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67024050|gb|CO452799.1|CO452799
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31354997|gb|CD439354.1|CD439354
EST:     CTCAGTTGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432583|gb|FK988684.1|FK988684
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429985|gb|FK988672.1|FK988672
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|32919907|gb|CF024719.1|CF024719
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|60336913|gb|DN203886.1|DN203886
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|32936327|gb|CF041139.1|CF041139
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429984|gb|FK988671.1|FK988671
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|19351347|gb|BM895879.1|BM895879
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435198|gb|FK988708.1|FK988708
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTG
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTG
EST: gi|67023203|gb|CO451952.1|CO451952
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432580|gb|FK988681.1|FK988681
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67011056|gb|CO439805.1|CO439805
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432584|gb|FK988685.1|FK988685
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31353433|gb|CD437790.1|CD437790
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|29946576|gb|CB816219.1|CB816219
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435186|gb|FK988696.1|FK988696
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|22521214|gb|BU080025.1|BU080025
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31359544|gb|CD443901.1|CD443901
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31353535|gb|CD437892.1|CD437892
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435184|gb|FK988694.1|FK988694
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|87154039|gb|DY398828.1|DY398828
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|6626409|gb|AW257941.1|AW257941
EST:     GAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGCGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: GAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429980|gb|FK988667.1|FK988667
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|30031628|gb|CB833479.1|CB833479
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429991|gb|FK988678.1|FK988678
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67011708|gb|CO440457.1|CO440457
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432579|gb|FK988680.1|FK988680
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211437784|gb|FK988712.1|FK988712
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|87152151|gb|DY396940.1|DY396940
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|28909554|gb|CB330988.1|CB330988
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432591|gb|FK988692.1|FK988692
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|20301520|gb|BQ164463.1|BQ164463
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31361053|gb|CD445410.1|CD445410
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATGAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435194|gb|FK988704.1|FK988704
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429990|gb|FK988677.1|FK988677
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429987|gb|FK988674.1|FK988674
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67030419|gb|CO459168.1|CO459168
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429981|gb|FK988668.1|FK988668
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|76281562|gb|DV021130.1|DV021130
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67040510|gb|CO466765.1|CO466765
EST:     GTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432586|gb|FK988687.1|FK988687
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|32809865|gb|CD962099.1|CD962099
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|22521582|gb|BU080393.1|BU080393
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|28576040|gb|CB281932.1|CB281932
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGCGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67021372|gb|CO450121.1|CO450121
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|26456226|gb|CA827809.1|CA827809
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|34391122|gb|CF384350.1|CF384350
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTCTGACTATTTGGG
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGG--CTCTGACTATTTGGG
EST: gi|211429979|gb|FK988666.1|FK988666
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|22819010|gb|BU499100.1|BU499100
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435187|gb|FK988697.1|FK988697
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|20208275|gb|BQ134364.1|BQ134364
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGG
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGG
EST: gi|211131241|gb|FL066393.1|FL066393
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435185|gb|FK988695.1|FK988695
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCNTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCNTCTGACTATTTGGG
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGC-TCTGGAGTTGAGGGATGGTGGC-TCTGACTATTTGGG
EST: gi|211435193|gb|FK988703.1|FK988703
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435195|gb|FK988705.1|FK988705
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|6964710|gb|AW433403.1|AW433403
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|28909616|gb|CB331015.1|CB331015
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|32909266|gb|CF014078.1|CF014078
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211131242|gb|FL066394.1|FL066394
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435191|gb|FK988701.1|FK988701
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|22546282|gb|BU098593.1|BU098593
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|19058240|gb|BM736907.1|BM736907
EST:     TCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: TCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|60355296|gb|DN222269.1|DN222269
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211429983|gb|FK988670.1|FK988670
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|13558380|gb|BG549736.1|BG549736
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTG-TCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|29130656|gb|CB381360.1|CB381360
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|19272521|gb|BM888777.1|BM888777
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31349581|gb|CD433938.1|CD433938
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|13490673|gb|BG517437.1|BG517437
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTTTATTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211130322|gb|FL066389.1|FL066389
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGNATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211432578|gb|FK988679.1|FK988679
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435192|gb|FK988702.1|FK988702
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|32908618|gb|CF013431.1|CF013431
EST:     CTCAGACGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31358035|gb|CD442392.1|CD442392
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|21987151|gb|BQ778679.1|BQ778679
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGG                         GTGTATATGAAAGCTTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGG
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACT-Ggtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATG-AAGC-TCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGG
EST: gi|15100536|gb|BI396327.1|BI396327
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31353699|gb|CD438056.1|CD438056
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|31350995|gb|CD435352.1|CD435352
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCTGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435196|gb|FK988706.1|FK988706
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGAYTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211435189|gb|FK988699.1|FK988699
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|211131240|gb|FL066392.1|FL066392
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
EST: gi|67038520|gb|CO464838.1|CO464838
EST:     CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTG                         GTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA
genomic: CTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCAGCTGTTCCCAGTGGAGCATCAACTGgtgggttatt ... ctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttaaggtctatcttatgtcttgcagtagctgatagtgatgttgtcctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGAAGGGTGTCTCCAAG
                          agctgat  putative branch site (score: 4)
                                           tcctgttt  putative PPT
        tatcttat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtgggttattttggaataatattagtagtgttcaggttactcatttgcttttgctttacatctttccatgttttgagcatatcctctaatccttaaggtctatcttatgtcttgcagtagctgatagtgatgttgtcctgtttacagGTGTATATGAAGCTCTGGAGTTGAGGGATGGTGGCTCTGACTATTTGGGGAAGGGTGTCTCCAAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGTGG