1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtaagctgtggtgatcgctggcaagggtcacatcttaatggcacatgatgcccatgaatgttgtgatgaccaagaccaatgctaacttttaatctcaagattgatgctaactgaatcatcagagctcaaagagatgttgctaatttctatgtctgttgcgattatcctgcagGAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTCTCTACAATATATACGAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G043862_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGGCTGGAGCAAGTATGCTGCTCCTTCCGGGCGTTGTGCTACATTCTTG GAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTCEST: gi|211322504|gb|FL455349.1|FL455349
genomic: ATGGCTGGAGCAAGTATGCTGCTCCTTCCGGGCGTTGTGCTACATTCTTGgtaagctgtg ... tatcctgcagGAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTC
EST: ATGGCTGGAGCAAGTATGCTGCTCCTTCCGGGCGTTGTGCTACATTCTTG GAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTCEST: gi|32826199|gb|CD965877.1|CD965877
genomic: ATGGCTGGAGCAAGTATGCTGCTCCTTCCGGGCGTTGTGCTACATTCTTGgtaagctgtg ... tatcctgcagGAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTC
EST: ATGGCTGGAGCAAGTATGCTGCTCCTTCCGGGCGTTGTGCTACATTCTTG GAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTC
genomic: ATGGCTGGAGCAAGTATGCTGCTCCTTCCGGGCGTTGTGCTACATTCTTGgtaagctgtg ... tatcctgcagGAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTC
atcagagctcaaagagatgttgctaatttctatgtctgttgcgattatcctgcagGAATTCGGTAACATTGAAGCACCTATGTATGCAAGGCTTCGTCACTTCTTCTCTACAATATATACGAG
tgctaat putative branch site (score: 67)
ttatcct putative PPT
taatttctat TA-rich tract