1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...aataaaaatgattcacgttgatttactgaactaaggaaagcttttgtgttctttcttggcttgctaaaacttctgtaatccagtaatcgtcctagtgcagGTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCTGATGATATCATTGAGACAATCCTGGATAAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G015324_T03 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGTTCAAGCTATATGATATGGATAGCACAGGGTTTATTGAACGGAAGGAG GTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCTEST: gi|78116066|gb|DV534454.1|DV534454
genomic: CGTTCAAGCTATATGATATGGATAGCACAGGGTTTATTGAACGGAAGGAGgtaatttttg ... cctagtgcagGTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCT
EST: ATGATATGGATAGCACAGGGTTTATTGAACGGAAGGAG GTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCTEST: gi|113703680|gb|EE681184.1|EE681184
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EST: GCACAGGGTTTATTGAACGGAAGGAG GTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCTEST: gi|28985958|gb|CB350899.1|CB350899
genomic: GCACAGGGTTTATTGAACGGAAGGAGgtaatttttg ... cctagtgcagGTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCT
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genomic: TTCAAGCTATATGATATGGATAGCACAGGGTTTATTGAACGGAAGGAGgtaatttttg ... cctagtgcagGTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCT
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gtgttctttcttggcttgctaaaacttctgtaatccagtaatcgtcctagtgcagGTTAAGCAGATGTTAATTGCTCTTCTAGGAGAATCAGAAATGAGGCTATCTGATGATATCATTGAGACAATCCTGGATAAG
tgctaaa putative branch site (score: 2)
tcgtcct putative PPT
taaaactt TA-rich tract