1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
gtaataatagttcacacttgttgaaaaagaatttattttttttctacgacggttattaacttatctctgttctttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGTACCCTTTTCTTTTATTCCATGCTACAAAGTTTGGTGTCGTAACAAGCA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G028535_T02 |
intron # | 20 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGA-G--- GCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTTCTCCTTTTAAEST: gi|6022040|gb|AW066983.1|AW066983
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGAC-TCCCCTTTTAA
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCCCAAGGATCTTCCTTTGCAATGA-G--- GCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGEST: gi|61118748|gb|DN559709.1|DN559709
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTTCCCTTTTAAGEST: gi|60344250|gb|DN211223.1|DN211223
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGEST: gi|60355192|gb|DN222165.1|DN222165
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGEST: gi|211181077|gb|FL441225.1|FL441225
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTTCCCTTTTAAGEST: gi|101391685|gb|EB817779.1|EB817779
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCCCAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGEST: gi|149066719|gb|EE286860.2|EE286860
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGEST: gi|67017479|gb|CO446228.1|CO446228
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
EST: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAA --A--TAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
genomic: GACAAGGGAGTGGTTTACACCCACAAGGATCTTCCTTTGCAATGAGGCAAgtaataatag ... tttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAG
agaatttattttttttctacgacggttattaacttatctctgttctttgttgcagGCAAATAACCTCCGTTGTGGTCGTAACGAATGGCTGGACTCCCCTTTTAAGTACCCTTTTCTTTTATTCCATGCTACAAAGTTTGGTGTCGTAACAAGCA
tattaac putative branch site (score: 548)
cttatctctgttcttt CT-rich tract
ttattttttttcta TA-rich tract