1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtatggactccaatcttggcctttgtttttgtgtttatttttgcctagcatgttatttattttcaaagtcttgatgattagGTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGAACCTTCTCAAGCACCCTGATTTCTTGACGGATACAAAGCTTGCTATAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G442404_T01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACTAACTGAAATTGATGGACAAGCTATTAGCCTGTTTGGTGTTTTTGACG GTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGAEST: gi|8103065|gb|AW927729.1|AW927729
genomic: ACTAACTGAAATTGATGGACAAGCTATTAGCCTGTTCGGTGTTTTTGACGgtatggactc ... tgatgattagGTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGA
EST: CTAACTGAAATTGATGGACAAGCTATTAGCCTGTTTGGTGTGTTTTGACG GTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGEST: gi|32931838|gb|CF036650.1|CF036650
genomic: CTAACTGAAATTGATGGACAAGCTATTAGCCTGTTCGGTGT-TTTTGACGgtatggactc ... tgatgattagGTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAG
EST: ACTAACTGAAATTGATGGACAAGCTATTAGCCTGTTCGGTGTTTTTGACG GTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGA
genomic: ACTAACTGAAATTGATGGACAAGCTATTAGCCTGTTCGGTGTTTTTGACGgtatggactc ... tgatgattagGTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGA
ttttgtgtttatttttgcctagcatgttatttattttcaaagtcttgatgattagGTCATGGTGGATCACGTGCTGCTGAGTATTTGAGGGAGCACTTGTTTGAGAACCTTCTCAAGCACCCTGATTTCTTGACGGATACAAAGCTTGCTATAA
tcttgat putative branch site (score: 4)
atgttatttattttca TA-rich tract