1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtatgattagttgaaagaaaggtacaacatcaccttacgtgttgaattgccttgattaagaaatttatgggtagccttccgtgtgtgtatgtgtgtgcagATTCAGCCCTTGGCTTTCTGGGCATGTTTGACAAAGTTGAATAGCTATGAAACCGAAAACAACTGCCAAATGTACATGTTCTGAATCAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G384298_T02 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATCTTGTTGTGGTTCATGAGCACTGAGCTATACTTCAACTTAACTG ATTCAGCCCTTGGCTTTCTGGGCATGTTTGACAAAGTTGAATAGCTATGAAEST: gi|76925337|gb|DV170387.1|DV170387
genomic: ATCTTGTTGTGGTTCATGAGCACTGAGCTATACTTCAACTTAACTGgtatgattag ... gtgtgtgcagATTCAGCCCTTGGCTTTCTGGGCATGTTTGACAAAGTTGAATAGCTATGAA
EST: ATCTTGTTGTGGTTCATGAGCACTGAGCTATACTTCAACTTAACTG ATTCAGCCCTTGGCTTTCTGGGCATGTTTGACAAAGTTGAATAGCTATGAA
genomic: ATCTTGTTGTGGTTCATGAGCACTGAGCTATACTTCAACTTAACTGgtatgattag ... gtgtgtgcagATTCAGCCCTTGGCTTTCTGGGCATGTTTGACAAAGTTGAATAGCTATGAA
attgccttgattaagaaatttatgggtagccttccgtgtgtgtatgtgtgtgcagATTCAGCCCTTGGCTTTCTGGGCATGTTTGACAAAGTTGAATAGCTATGAAACCGAAAACAACTGCCAAATGTACATGTTCTGAATCAA
ccttgat putative branch site (score: 2)
ttgattaagaaattta TA-rich tract