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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...atagaaagtaattcctccttttcatggtgccagagatgacacattcctttttgcaagtttttagttcacatgtaaaactcttgctattttaataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAACACAC

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G152775_T04
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G152775_T04 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os02g53060.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
-atagaaagtaat--tcctccttttcatggtgccagagatgacacattcctttttgcaagtttttagttcacatgtaaaactcttgctattttaataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAACACAC
  |||    || |  ||  | | |   |  |  |||  | | ||  ||||      | |||  |   ||||||||||||  | |   | | |   |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
tgtagttgttagtagtcggcttctaattattatcagctaaggcat-ttccaagagtccagtagt--attcacatgtaaatatttgtttctctctgtctcacagGCTGCTGATACACAAGTAATTTCCGATTATGTACGCTATTTTCTCCACCAACACAC

upper sequence: GRMZM2G152775_T04 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os06g04800.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
atagaaagtaattcctccttttcatggtgccagagatg-acacattcctttttgcaagtttt----tagttcacatgtaaaactcttgctattttaataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAACACAC
 |      || ||  |  |  ||   || | |   | | |   |||      | ||   |||    ||||||||  |||  |   ||   |||    |  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
-tttttcatagttgttaatagtc-cagtactaagtaagtaagtattatcagatacagcatttccaatagttcactagtattatatttctcatt---gtctcacagGCTGCCGACACACAAGTCATTTCGGAATATGTACGCTATTTTCTCCACCAACACAC
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|60359395|gb|DN226368.1|DN226368
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|84977380|gb|DW475802.1|DW475802
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCCGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|60343030|gb|DN210003.1|DN210003
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211422181|gb|FK988627.1|FK988627
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211427386|gb|FK988649.1|FK988649
EST:     CAAGATTACTNCA-CTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCCAC-A
genomic: CAAGATTACT-CAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCC-ACCA
EST: gi|211427393|gb|FK988656.1|FK988656
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211422178|gb|FK988624.1|FK988624
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211419575|gb|FK988608.1|FK988608
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211449613|gb|FL033174.1|FL033174
EST:     ATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|32860271|gb|CD999952.1|CD999952
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCGCCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|148937130|gb|EC881305.2|EC881305
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|148951987|gb|EC897769.2|EC897769
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|89252178|gb|DY623964.1|DY623964
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAC
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|9742817|gb|BE518965.1|BE518965
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211451729|gb|FL033175.1|FL033175
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211427388|gb|FK988651.1|FK988651
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211424798|gb|FK988647.1|FK988647
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTYCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCYACCA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGT-CATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCA
EST: gi|211424785|gb|FK988634.1|FK988634
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCAC-AA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|71423917|gb|DR806179.1|DR806179
EST:     TGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: TGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|71303126|gb|DR787669.1|DR787669
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCCACCA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCC-ACCA
EST: gi|76016135|gb|DT943305.1|DT943305
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|60337945|gb|DN204918.1|DN204918
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211422175|gb|FK988621.1|FK988621
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|67013660|gb|CO442409.1|CO442409
EST:     CAACTGACTGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: CAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211285041|gb|FK988603.1|FK988603
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|67014760|gb|CO443509.1|CO443509
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|149102586|gb|EE287944.2|EE287944
EST:     ACCAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211419585|gb|FK988618.1|FK988618
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211419577|gb|FK988610.1|FK988610
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|9953599|gb|BE640182.1|BE640182
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211424789|gb|FK988638.1|FK988638
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211424791|gb|FK988640.1|FK988640
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|101398688|gb|EB821216.1|EB821216
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|32935675|gb|CF040487.1|CF040487
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|74235912|gb|DT643826.1|DT643826
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCGCCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211427387|gb|FK988650.1|FK988650
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|89247977|gb|DY619763.1|DY619763
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|76925303|gb|DV170371.1|DV170371
EST:     CAAGATTTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACCCAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCC-CCAA
genomic: CAAGATT-ACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|148952879|gb|EC898871.2|EC898871
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|148971697|gb|EE022425.2|EE022425
EST:     ACGAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCGA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211424796|gb|FK988645.1|FK988645
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211422173|gb|FK988619.1|FK988619
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|211422177|gb|FK988623.1|FK988623
EST:     ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCT                         GCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
genomic: ACAAGATTACTCAACTGACAGACAATGTGTATGTCTGTCGCTCTGGATCTgtaagtgcca ... aataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAA
EST: gi|74235911|gb|DT643825.1|DT643825
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 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

cctttttgcaagtttttagttcacatgtaaaactcttgctattttaataccacagGCTGCTGATACACAAGTCATTTCGGATTATGTACGCTATTTCCTCCACCAACACAC
                                         ttttaat  putative branch site (score: 3)
                                   ttgctattttaata  TA-rich tract