Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgagtcctttgcctgctaccaatggtaattttagtttgagcttttgtatttaatattttttgctgacaaactttgttctacttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTCTCACAAGGCTGTTAACGAATATAAGGAGGCTAAGGCG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G149751_T02
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G149751_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os12g42876.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 1
gtgagtcctttgcct--------gcta-ccaatggtaattttagtttgagcttttgtatttaatattttttgctgacaaactttgttctacttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTCTCACAAGGCTGTTAACGAATATAAGGAGGCTAAGGCG
|| |||||||||| |        |||  |  |  ||||  ||   || || |||   ||| || |||||  ||| ||      |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||
gtaagtcctttgcttccatttaagctgtctgacagtaacattttatttagatttcacattcaacatttt--gctaactgctgctgttgtgcctttacagCCACTTTATCGTCCCTGAACTTGGTCCCAACACCAAGTTCTCCTACTCTTCCCACAAGGCTGTGAATGAATACAAGGAGGCTAAGGCG

upper sequence: GRMZM2G149751_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os12g42884.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
gtgagtcctttgcctgc---ta------ccaatggtaatt-ttagtttgagcttttgtatttaatattttttgctgacaaactttgttctacttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTCTCACAAGGCTGTTAACGAATATAAGGAGGCTAAGGCG
|| ||| |||||| | |   ||      |  |  ||||   ||   || |  |||| |||| || |||||  ||| ||      |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||
gtaagtactttgcttccatttaagatgtctgacagtaaacattttatttaatttttatattcaacatttta-gctaactggtgctgtt-tacctttacagCCACTTTATCGTCCCTGAACTTGGTCCCAACACCAAGTTCTCCTACTCTTCCCACAAGGCTGTGAATGAATACAAGGAGGCCAAGGCG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|33101935|gb|CF061895.1|CF061895
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211004701|gb|FL002831.1|FL002831
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148996047|gb|EE035301.2|EE035301
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148952985|gb|EE152460.2|EE152460
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33101295|gb|CF061255.1|CF061255
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927822|gb|CF032634.1|CF032634
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927851|gb|CF032663.1|CF032663
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927265|gb|CF032077.1|CF032077
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148944041|gb|EC889124.2|EC889124
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32847134|gb|CD986815.1|CD986815
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211010249|gb|FL002854.1|FL002854
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCNAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33101676|gb|CF061636.1|CF061636
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAGCTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007467|gb|FL002836.1|FL002836
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|18964257|gb|BM660902.1|BM660902
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33102369|gb|CF062329.1|CF062329
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGCTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927533|gb|CF032345.1|CF032345
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33101430|gb|CF061390.1|CF061390
EST:     AACACCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|5268947|gb|AI770911.1|AI770911
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148935845|gb|EC879892.2|EC879892
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|149015499|gb|EE045382.2|EE045382
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211013032|gb|FL002871.1|FL002871
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32844287|gb|CD983968.1|CD983968
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33102508|gb|CF062468.1|CF062468
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33101885|gb|CF061845.1|CF061845
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|5566808|gb|AI881674.1|AI881674
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33102419|gb|CF062379.1|CF062379
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211334938|gb|FL421998.1|FL421998
EST:     GTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: GTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33102414|gb|CF062374.1|CF062374
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|87151948|gb|DY396737.1|DY396737
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007476|gb|FL002845.1|FL002845
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|149071493|gb|EE159885.2|EE159885
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211004693|gb|FL002823.1|FL002823
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCA
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCA
EST: gi|18655215|gb|BM500020.1|BM500020
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32850001|gb|CD989682.1|CD989682
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33102239|gb|CF062199.1|CF062199
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32843868|gb|CD983549.1|CD983549
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|149070803|gb|EE159213.2|EE159213
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211015811|gb|FL002884.1|FL002884
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32846085|gb|CD985766.1|CD985766
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211004696|gb|FL002826.1|FL002826
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|18964765|gb|BM661197.1|BM661197
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927444|gb|CF032256.1|CF032256
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAG
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAG
EST: gi|32836864|gb|CD976542.1|CD976542
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|67034979|gb|CO463512.1|CO463512
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|5566975|gb|AI881886.1|AI881886
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211013023|gb|FL002862.1|FL002862
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927811|gb|CF032623.1|CF032623
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33100758|gb|CF060718.1|CF060718
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148948540|gb|EC894062.2|EC894062
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211013025|gb|FL002864.1|FL002864
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211015801|gb|FL002874.1|FL002874
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGATTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|30705271|gb|CD058728.1|CD058728
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGGGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|149087273|gb|EE176809.2|EE176809
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211010242|gb|FL002847.1|FL002847
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211010246|gb|FL002851.1|FL002851
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATCGTGCACAAACAC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACAC
EST: gi|32806652|gb|CD958886.1|CD958886
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148962844|gb|EE013765.2|EE013765
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211010252|gb|FL002857.1|FL002857
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007473|gb|FL002842.1|FL002842
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32846438|gb|CD986119.1|CD986119
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|149084879|gb|EE174385.2|EE174385
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211015810|gb|FL002883.1|FL002883
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAAATGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32928003|gb|CF032815.1|CF032815
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32929608|gb|CF034420.1|CF034420
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148941857|gb|EC886836.2|EC886836
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|5268597|gb|AI770561.1|AI770561
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33101700|gb|CF061660.1|CF061660
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33102128|gb|CF062088.1|CF062088
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|18384328|gb|BM417527.1|BM417527
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211105226|gb|FL409179.1|FL409179
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007469|gb|FL002838.1|FL002838
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211010243|gb|FL002848.1|FL002848
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|5268488|gb|AI770452.1|AI770452
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148943088|gb|EC888142.2|EC888142
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32850707|gb|CD990388.1|CD990388
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32846029|gb|CD985710.1|CD985710
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211010245|gb|FL002850.1|FL002850
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927945|gb|CF032757.1|CF032757
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211013031|gb|FL002870.1|FL002870
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927261|gb|CF032073.1|CF032073
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|5555424|gb|AI881375.1|AI881375
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007465|gb|FL002834.1|FL002834
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927611|gb|CF032423.1|CF032423
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211004695|gb|FL002825.1|FL002825
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|19821826|gb|BQ047850.1|BQ047850
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211015803|gb|FL002876.1|FL002876
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211013030|gb|FL002869.1|FL002869
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGTGCCCAAACACCAAGGTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007466|gb|FL002835.1|FL002835
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCC-AAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927189|gb|CF032001.1|CF032001
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148959014|gb|EC905192.2|EC905192
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32836217|gb|CD975895.1|CD975895
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32929926|gb|CF034738.1|CF034738
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007470|gb|FL002839.1|FL002839
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|149087781|gb|EE177100.2|EE177100
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927476|gb|CF032288.1|CF032288
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148930977|gb|EC873501.2|EC873501
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211306872|gb|FL374673.1|FL374673
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33100636|gb|CF060596.1|CF060596
EST:     GACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|148961821|gb|EE012603.2|EE012603
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|33101927|gb|CF061887.1|CF061887
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32928056|gb|CF032868.1|CF032868
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211013034|gb|FL002873.1|FL002873
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32838294|gb|CD977972.1|CD977972
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|32927887|gb|CF032699.1|CF032699
EST:     AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
EST: gi|211007464|gb|FL002833.1|FL002833
EST:     AACGCCACTGTCCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTA                         CCACTTTATTGTCCCGGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC
genomic: AACGCCACTGTTCCTGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAgtgagtcctt ... acttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tttgagcttttgtatttaatattttttgctgacaaactttgttctacttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTCTCACAAGGCTGTTAACGAATATAAGGAGGCTAAGGCG
                          tgctgac  putative branch site (score: 2)
                                    ctttgttctactttt  putative PPT
       ttttgtatttaatatt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtgagtcctttgcctgctaccaatggtaattttagtttgagcttttgtatttaatattttttgctgacaaactttgttctacttttacagCCACTTTATTGTCCCTGAATTGGGCCCAAACACCAAGTTCTCCTATGCTTCTCACAAGGCTGTTAACGAATATAAGGAGGCTAAGGCG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGGAG