1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...gtagagtggtgatgcctgcttttttttgttaattagtgatttatatgtatttctctatgtattcgtctacacaatgaactgatggttttcttttgatcagCTACCTTGTCGCAGCAGCCATTTTGCAGTGCTTGTGGAGCCTTTTGCTAGCCTTTGTCGACATTTATGCACTTCTTGTCAAGCGATCGTTGAGAAATGCC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G136901_T01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTGAAATAGAGGATGAGATAGCAGATCTGCTGGAGATGGCCTTAATATG CTACCTTGTCGCAGCAGCCATTTTGCAGTGCTTGTGGAGCCTTTTGCTAGCEST: gi|211462304|gb|FL096438.1|FL096438
genomic: TTTGAAATAGAGGATGAGATAGCAGATCTGCTGGAGATGGCCTTAATATGgtacatataa ... ttttgatcagCTACCTTGTCGCAGCAGCCATTTTGCAGTGCTTGTGGAGCCTTTTGCTAGC
EST: TTTGAAATAGAGGATGAGATAGCAGATCTGCTGGAGATGGCCTTAATATG CTACCTTGTCGCAGCAGCCATTTTGCAGTGCTTGTGGAGCCTTTTGCTAGC
genomic: TTTGAAATAGAGGATGAGATAGCAGATCTGCTGGAGATGGCCTTAATATGgtacatataa ... ttttgatcagCTACCTTGTCGCAGCAGCCATTTTGCAGTGCTTGTGGAGCCTTTTGCTAGC
tgtatttctctatgtattcgtctacacaatgaactgatggttttcttttgatcagCTACCTTGTCGCAGCAGCCATTTTGCAGTGCTTGTGGAGCCTTTTGCTAGCCTTTGTCGACATTTATGCACTTCTTGTCAAGCGATCGTTGAGAAATGCC
aactgat putative branch site (score: 3)
ttttctttt putative PPT
ttttctttt TA-rich tract