1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtaggtcacctctcatgtgaataggcctgcttttgttctattgctgaataatgtaatagtattgacgattcttgctgctattttccagTGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTATCTTGGTCACACCACTTGGTGCACTTAGCATCATAATTAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G110398_T02 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGAATACAA TGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTAEST: gi|87152947|gb|DY397736.1|DY397736
genomic: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAAgtaggtcacc ... tattttccagTGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTA
EST: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAA TGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTAEST: gi|60340735|gb|DN207708.1|DN207708
genomic: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAAgtaggtcacc ... tattttccagTGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTA
EST: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAA TGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTAEST: gi|18384468|gb|BM417667.1|BM417667
genomic: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAAgtaggtcacc ... tattttccagTGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTA
EST: TGGTTACTCTTACTTGTATGACCCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAA TGATTGTTGGAGAAGTGGCT
genomic: TGGTTACTCTTACTTGTATGAACCATTATGGTGGGCAGGAATGATTACAAgtaggtcacc ... tattttccagTGATTGTTGGAGAAGTGGCT
tgttctattgctgaataatgtaatagtattgacgattcttgctgctattttccagTGATTGTTGGAGAAGTGGCTAACTTTGCAGCATATGCTTTTGCTCCTGCTATCTTGGTCACACCACTTGGTGCACTTAGCATCATAATTAG
tattgac putative branch site (score: 2)
ctattttcc putative PPT
aataatgtaatagtat TA-rich tract