1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...cattaattcttgtgttaaaaaatgctacctaaggttgttaccctgtccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G074300_T02 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGTCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|22546268|gb|BU098579.1|BU098579
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAAGTGGTGCCAAGGGTTEST: gi|26457601|gb|CA829184.1|CA829184
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGA-GTGGTGCCAAGGGTT
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211507270|gb|FL197054.1|FL197054
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|37424890|gb|CF650179.1|CF650179
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|148933725|gb|EC877641.2|EC877641
genomic: CTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCCCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTGEST: gi|18661874|gb|BM501626.1|BM501626
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGEST: gi|211374869|gb|FL197001.1|FL197001
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|4874453|gb|AI673973.1|AI673973
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTCCAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|32164835|gb|CD670153.1|CD670153
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|9254109|gb|BE344577.1|BE344577
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|27522126|gb|CA989232.1|CA989232
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211514357|gb|FL197096.1|FL197096
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211512006|gb|FL197086.1|FL197086
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|9254179|gb|BE344647.1|BE344647
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGCTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|29576818|gb|CB616930.1|CB616930
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211507278|gb|FL197062.1|FL197062
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGC-TGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCEST: gi|32864638|gb|CF004320.1|CF004320
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGC
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|76284526|gb|DV024094.1|DV024094
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|32850480|gb|CD990161.1|CD990161
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTCCAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGCCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211507269|gb|FL197053.1|FL197053
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|15053894|gb|BI359439.1|BI359439
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGTCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|22546706|gb|BU099017.1|BU099017
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|148991020|gb|EE032461.2|EE032461
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|21626375|gb|BQ621296.1|BQ621296
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211369553|gb|FL196974.1|FL196974
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211372204|gb|FL196985.1|FL196985
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|29947264|gb|CB816565.1|CB816565
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|6918465|gb|AW399995.1|AW399995
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211502560|gb|FL197032.1|FL197032
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: GGCTGAGTCCCTCCGCTANCA-GCTCCTCGGAGGCCTTGCCCGTC-GGAG GGGCTGCTATGGTGTTCTTCEST: gi|211374868|gb|FL197000.1|FL197000
genomic: GGCTGAGTCCCTCCGCTA-CAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCC-GTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTC
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGKGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|148956519|gb|EC902358.2|EC902358
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCEST: gi|22545535|gb|BU097894.1|BU097894
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTC
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211504914|gb|FL197044.1|FL197044
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211514361|gb|FL197100.1|FL197100
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211512000|gb|FL197080.1|FL197080
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211372200|gb|FL196981.1|FL196981
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGKTCTTCGCTTTGKTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211372194|gb|FL196975.1|FL196975
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|84351642|gb|DW246047.1|DW246047
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAAGGTTGEST: gi|211372206|gb|FL196987.1|FL196987
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTNGT-ATGGAGAGTGGTGC-AAGGGGTEST: gi|9952937|gb|BE639520.1|BE639520
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTT-GTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTT
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|91057136|gb|EB167554.1|EB167554
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|18654852|gb|BM499657.1|BM499657
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGGGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|89248143|gb|DY619929.1|DY619929
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|5398800|gb|AI812144.1|AI812144
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211507274|gb|FL197058.1|FL197058
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211031757|gb|FL369434.1|FL369434
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|31664617|gb|CD573550.1|CD573550
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: AGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|28930830|gb|CB334191.1|CB334191
genomic: AGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTG-CCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGEST: gi|211502555|gb|FL197027.1|FL197027
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
tccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG
tactaac putative branch site (score: 0)
cttgtttt putative PPT
tattaca TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| cattaattcttgtgttaaaaaatgctacctaaggttgttaccctgtccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - -attcttg
- - - - - - - -taaaaaa
- - - - - - - - - - - tgctacc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - taccctg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgcttgt