Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...cattaattcttgtgttaaaaaatgctacctaaggttgttaccctgtccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G074300_T01
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G074300_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os03g38000.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 1
---cattaattcttgtgttaaaaaatgctacctaaggttgttaccctgtccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG
      | ||  | |  ||   |  ||  | |||  |  |    | | ||   | || |  | ||    ||  |  |  |||| ||| ||||||    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
accttgttatggtagctttgttatgtgtgagctagtgcggaagtcgt-tctgatgtttctttcagat--gtcattgtctctaatatgtttgtttacgtgacagGGCTTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGCGAG

upper sequence: GRMZM2G074300_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 2
lower sequence: PP1S127_74V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 3
----------------cattaattcttgtgttaaaaaatgctacc------taaggttgttaccctgtccagt--attaca-gtt---agtctagttctccttactaacatgcttgttttgt-------cggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG
                 ||||    ||||  |||      |||        | |  ||| |   ||     ||  | | |  |||   ||   ||     | | || |  ||||  | ||         ||  ||||| || || || || ||  | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||
gtgtgtgcctcgtatctattagactttgtactaatccgcactattgcttgatcaccttgattttctacgaggttaactgcgcgttcagagctcagcgtatcgttctgatgtgctgatcttaaatctgaacgctagGGCTTGTTACGGAGTGCTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCCAAGGGTTGTGAG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|28361609|gb|CB239965.1|CB239965
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|76017326|gb|DT944496.1|DT944496
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211264435|gb|FL070938.1|FL070938
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGTCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|148999968|gb|EE037043.2|EE037043
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|71304431|gb|DR788336.1|DR788336
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|26457601|gb|CA829184.1|CA829184
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|37424890|gb|CF650179.1|CF650179
EST:     CTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|149083927|gb|EE173304.2|EE173304
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|148933725|gb|EC877641.2|EC877641
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCCCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|18661874|gb|BM501626.1|BM501626
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGG
EST: gi|28361791|gb|CB240147.1|CB240147
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211374869|gb|FL197001.1|FL197001
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|78121892|gb|DV540276.1|DV540276
EST:     TCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: TCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|4874453|gb|AI673973.1|AI673973
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTCCAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|32164835|gb|CD670153.1|CD670153
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|9254109|gb|BE344577.1|BE344577
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|27522126|gb|CA989232.1|CA989232
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211514361|gb|FL197100.1|FL197100
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211514357|gb|FL197096.1|FL197096
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|21988014|gb|BQ779542.1|BQ779542
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211512006|gb|FL197086.1|FL197086
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|91057136|gb|EB167554.1|EB167554
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|9254179|gb|BE344647.1|BE344647
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGCTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|60343353|gb|DN210326.1|DN210326
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|29576818|gb|CB616930.1|CB616930
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|31998117|gb|CD661932.1|CD661932
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211264443|gb|FL070946.1|FL070946
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211507278|gb|FL197062.1|FL197062
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGC-TGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGC
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGC
EST: gi|4886195|gb|AI677315.1|AI677315
EST:     GAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: GAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|76284526|gb|DV024094.1|DV024094
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|27521990|gb|CA989096.1|CA989096
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|22542258|gb|BU092696.1|BU092696
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211507270|gb|FL197054.1|FL197054
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|60395599|gb|DN228469.1|DN228469
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|71436918|gb|DR817968.1|DR817968
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|67015398|gb|CO444147.1|CO444147
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|149044287|gb|EE047535.2|EE047535
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|5455784|gb|AI833474.1|AI833474
EST:     GCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: GCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|22715617|gb|BU197866.1|BU197866
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|32864638|gb|CF004320.1|CF004320
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211507274|gb|FL197058.1|FL197058
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211264444|gb|FL070947.1|FL070947
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|32850480|gb|CD990161.1|CD990161
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTCCAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGCCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|71770189|gb|DR968126.1|DR968126
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|113702981|gb|EE680485.1|EE680485
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|4886094|gb|AI677214.1|AI677214
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211507269|gb|FL197053.1|FL197053
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|5439322|gb|AI820243.1|AI820243
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211516715|gb|FL197112.1|FL197112
EST:     CAGGC--AGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|15053894|gb|BI359439.1|BI359439
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGTCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|28568922|gb|CB280797.1|CB280797
EST:     AGGCTGGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTG
genomic: AGGCT-GAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|110523710|gb|EE027894.1|EE027894
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|148991020|gb|EE032461.2|EE032461
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|74241306|gb|DT649220.1|DT649220
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|21626375|gb|BQ621296.1|BQ621296
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211369553|gb|FL196974.1|FL196974
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|29576817|gb|CB616929.1|CB616929
EST:     TCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: TCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|76280736|gb|DV020304.1|DV020304
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|15053893|gb|BI359438.1|BI359438
EST:     GCTCCTCGGAGGTCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: GCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211377531|gb|FL197007.1|FL197007
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211372204|gb|FL196985.1|FL196985
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|29947264|gb|CB816565.1|CB816565
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|94480031|gb|EB708989.1|EB708989
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|6918465|gb|AW399995.1|AW399995
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|110195743|gb|EC877640.1|EC877640
EST:     CAGGCTGAGTCCTTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|29946514|gb|CB816187.1|CB816187
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211507268|gb|FL197052.1|FL197052
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|149109486|gb|EE190225.2|EE190225
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|91871102|gb|EB401244.1|EB401244
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211502560|gb|FL197032.1|FL197032
EST:     GGCTGAGTCCCTCCGCTANCA-GCTCCTCGGAGGCCTTGCCCGTC-GGAG                         GGGCTGCTATGGTGTTCTTC
genomic: GGCTGAGTCCCTCCGCTA-CAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCC-GTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTC
EST: gi|211374868|gb|FL197000.1|FL197000
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGKGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|67020703|gb|CO449452.1|CO449452
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|74233864|gb|DT641778.1|DT641778
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|148956519|gb|EC902358.2|EC902358
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTC
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTC
EST: gi|22545535|gb|BU097894.1|BU097894
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|37397371|gb|CF635983.1|CF635983
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|30031573|gb|CB833424.1|CB833424
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|31664617|gb|CD573550.1|CD573550
EST:     AGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: AGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTG-CCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|71439153|gb|DR820203.1|DR820203
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211504914|gb|FL197044.1|FL197044
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|110532862|gb|EE037042.1|EE037042
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|60356933|gb|DN223906.1|DN223906
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211512000|gb|FL197080.1|FL197080
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211372200|gb|FL196981.1|FL196981
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGKTCTTCGCTTTGKTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211372194|gb|FL196975.1|FL196975
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|67013922|gb|CO442671.1|CO442671
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|149069758|gb|EE158144.2|EE158144
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|84351642|gb|DW246047.1|DW246047
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAAGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211509642|gb|FL197077.1|FL197077
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|89251839|gb|DY623625.1|DY623625
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211372206|gb|FL196987.1|FL196987
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTNGT-ATGGAGAGTGGTGC-AAGGGGT
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTT-GTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTT
EST: gi|9952937|gb|BE639520.1|BE639520
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|6127310|gb|AW129835.1|AW129835
EST:     AGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: AGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|88752356|gb|DY536497.1|DY536497
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|78026439|gb|DV494826.1|DV494826
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|76280737|gb|DV020305.1|DV020305
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|149105751|gb|EE291331.2|EE291331
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|60347205|gb|DN214178.1|DN214178
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|18654852|gb|BM499657.1|BM499657
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGGGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|5398800|gb|AI812144.1|AI812144
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|71304430|gb|DR788335.1|DR788335
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211031757|gb|FL369434.1|FL369434
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|148981803|gb|EE027895.2|EE027895
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|148961778|gb|EE012555.2|EE012555
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|22546268|gb|BU098579.1|BU098579
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAAGTGGTGCCAAGGGTT
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGA-GTGGTGCCAAGGGTT
EST: gi|149044418|gb|EE047536.2|EE047536
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|74233592|gb|DT641506.1|DT641506
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|28930830|gb|CB334191.1|CB334191
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|22546706|gb|BU099017.1|BU099017
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|29130998|gb|CB381702.1|CB381702
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|89248143|gb|DY619929.1|DY619929
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
EST: gi|211502555|gb|FL197027.1|FL197027
EST:     CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAG                         GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG
genomic: CAGGCTGAGTCCCTCCGCTACAAGCTCCTCGGAGGCCTTGCCGTCCGGAGgtataacttg ... ttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG
                             tactaac  putative branch site (score: 0)
                                       cttgtttt  putative PPT
     tattaca  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
cattaattcttgtgttaaaaaatgctacctaaggttgttaccctgtccagtattacagttagtctagttctccttactaacatgcttgttttgtcggcagGGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGAGA