1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...tacttgcgttttttattggactgaggtatcaaataaacatgctatttcttcttggtcttccttgcttagtttgctgataaaccttttgtatcaactatagGCGTGCCTTTTATGACCGAAGGATATCCCAGGAGGTCAGTGGTGATGCTCTGGGTGAGGTAAACTTTGGGATGACTTATTTCTTGATCCATGACTCTTGC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G054136_T06 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCTTCCACCGGGTGCCAAAAGAAGCTGGAAATCGATGACGACCAGAAGCT ACGTGCCTTTTATGACCGAAGGATATCCCAGGAGGTCAGTGGTGATGCTCTEST: gi|149075315|gb|EE163821.2|EE163821
genomic: CCTTCCACCGGGTGCCAAAAGAAGCTGGAAATCGATGACGACCAGAAGCTgtgagtgttt ... tcaactatagGCGTGCCTTTTATGACCGAAGGATATCCCAGGAGGTCAGTGGTGATGCTCT
EST: CCTTCCACCGGGTGCCAAAAGAAGCTGGAAATCGATGACGACCAGAAGCT GCGTGCCTTTTATGACCGAAGGATATCCCAGGAGGTCAGTGGTGATGCTCT
genomic: CCTTCCACCGGGTGCCAAAAGAAGCTGGAAATCGATGACGACCAGAAGCTgtgagtgttt ... tcaactatagGCGTGCCTTTTATGACCGAAGGATATCCCAGGAGGTCAGTGGTGATGCTCT
ttcttcttggtcttccttgcttagtttgctgataaaccttttgtatcaactatagGCGTGCCTTTTATGACCGAAGGATATCCCAGGAGGTCAGTGGTGATGCTCTGGGTGAGGTAAACTTTGGGATGACTTATTTCTTGATCCATGACTCTTGC
tgctgat putative branch site (score: 3)
ttttgtat TA-rich tract