1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtaacttaccaactcttctttcctttgtaagattctatacatgaatgccacacttgagggataatgaggatgcacaattaatgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGGCCAAGTTTGGACCCCTAGATGATTGTGTCGTCATGAAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G030902_T04 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|31664299|gb|CD573024.1|CD573024
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345133|gb|FL007069.1|FL007069
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345131|gb|FL007067.1|FL007067
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345128|gb|FL007064.1|FL007064
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211347524|gb|FL007073.1|FL007073
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345132|gb|FL007068.1|FL007068
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345126|gb|FL007062.1|FL007062
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345123|gb|FL007059.1|FL007059
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|6564152|gb|AW231774.1|AW231774
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345130|gb|FL007066.1|FL007066
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345122|gb|FL007058.1|FL007058
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345125|gb|FL007061.1|FL007061
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345134|gb|FL007070.1|FL007070
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345127|gb|FL007063.1|FL007063
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345135|gb|FL007071.1|FL007071
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGEST: gi|211345129|gb|FL007065.1|FL007065
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
EST: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTG GTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
genomic: TTTTTGAACATTGATCTGTAGCCAGTGCTGCAATGGCTACAAAGCTTGTGgtaacttacc ... atgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATG
tatacatgaatgccacacttgagggataatgaggatgcacaattaatgcacctagGTTCTCGGTATCCCCTGGGATGTTGACACTGAAGGGTTACGAGAGTACATGGCCAAGTTTGGACCCCTAGATGATTGTGTCGTCATGAAG
aattaat putative branch site (score: 3)
acaattaat TA-rich tract