1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
...tgttgactctagctattggtttgaggtattgacccaaacatctattgaactcctgtctggtaacagaagcttatattactgtcacttatgtttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAGGCATTGACACAAGCATCGAGCTAATAAAAACACTGAGCAGTGTCTCTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G014116_T02 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|17931575|gb|BM268535.1|BM268535
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|31358688|gb|CD443045.1|CD443045
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211429639|gb|FL201076.1|FL201076
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211427058|gb|FL201071.1|FL201071
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATCCCACACCAEST: gi|211427045|gb|FL201058.1|FL201058
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|18166644|gb|BM336483.1|BM336483
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|32919590|gb|CF024402.1|CF024402
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|31355001|gb|CD439358.1|CD439358
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211424445|gb|FL201051.1|FL201051
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGNCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACNTTGATTTGACACCAEST: gi|31355164|gb|CD439521.1|CD439521
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211427059|gb|FL201072.1|FL201072
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTNAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAGAGCAGTGGAGTATATTAATTTGACACCAEST: gi|61236504|gb|DN586255.1|DN586255
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|31355423|gb|CD439780.1|CD439780
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211427052|gb|FL201065.1|FL201065
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211429642|gb|FL201079.1|FL201079
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211424446|gb|FL201052.1|FL201052
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATNAATTTGACACCAEST: gi|14202839|gb|BG836516.1|BG836516
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211427055|gb|FL201068.1|FL201068
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|6626373|gb|AW257905.1|AW257905
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATCTGACACCAEST: gi|211427057|gb|FL201070.1|FL201070
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211429638|gb|FL201075.1|FL201075
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|5555401|gb|AI881352.1|AI881352
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211427047|gb|FL201060.1|FL201060
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211424450|gb|FL201056.1|FL201056
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211427053|gb|FL201066.1|FL201066
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTATATTAATTTGACACCAEST: gi|211427056|gb|FL201069.1|FL201069
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|18161887|gb|BM331726.1|BM331726
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|18168671|gb|BM338511.1|BM338511
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: CAGATCGTTCTCCTATGTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211427046|gb|FL201059.1|FL201059
genomic: CAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTATATTAATTTGACACCAEST: gi|31350034|gb|CD434391.1|CD434391
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211429636|gb|FL201073.1|FL201073
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|13515666|gb|BG517942.1|BG517942
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: CCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGGTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|108824160|gb|EC278168.1|EC278168
genomic: CCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|71448354|gb|DR829404.1|DR829404
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211429640|gb|FL201077.1|FL201077
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211427048|gb|FL201061.1|FL201061
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211429641|gb|FL201078.1|FL201078
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|111991033|gb|EE331916.1|EE331916
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211424449|gb|FL201055.1|FL201055
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|31354458|gb|CD438815.1|CD438815
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|32943215|gb|CF048034.1|CF048034
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTEST: gi|211427054|gb|FL201067.1|FL201067
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGT
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|31910184|gb|CD651297.1|CD651297
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAEST: gi|211429637|gb|FL201074.1|FL201074
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211424448|gb|FL201054.1|FL201054
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCAEST: gi|211427049|gb|FL201062.1|FL201062
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
EST: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAG GCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTAATTTGACACCA
genomic: TAAACGACCAGATCGTTCTCCTATCTAAGAGGAGAGGCCAGCTTAAGCAGgtcaggctct ... tttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCA
tgaactcctgtctggtaacagaagcttatattactgtcacttatgtttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAGGCATTGACACAAGCATCGAGCTAATAAAAACACTGAGCAGTGTCTCTG
tggtaac putative branch site (score: 275)
ttatgtttatt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tgttgactctagctattggtttgaggtattgacccaaacatctattgaactcctgtctggtaacagaagcttatattactgtcacttatgtttattgcagGCTATTACTGCTATGGTTCAGAAAGCAATGGAGTACATTGATTTGACACCAGGCATTGACACAAGCATCGAGCTAATAAAAACACTGAGCAGTGTCTCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCAG