1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
gtaagtcgctgcagccttatttttttatttactctctgatccgataatcgcagtgattgggttcagtgacgttgtgtttctgatcctggttcgaccgctccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTGGCGCGCCTGATGACTGGGAGGGGGAATTCTTCCCCGGCGTCCCGAAAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G005493_T01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458127|gb|FL012363.1|FL012363
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|149080694|gb|EE169755.2|EE169755
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211023369|gb|FK982681.1|FK982681
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211302405|gb|FL012357.1|FL012357
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211302401|gb|FL012353.1|FL012353
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458128|gb|FL012364.1|FL012364
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCA-CGAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGEST: gi|211458140|gb|FL012376.1|FL012376
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGC-AGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGG
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCWGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCA-SAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211302399|gb|FL012351.1|FL012351
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458138|gb|FL012374.1|FL012374
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211302400|gb|FL012352.1|FL012352
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211020950|gb|FK982676.1|FK982676
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458126|gb|FL012362.1|FL012362
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211020949|gb|FK982675.1|FK982675
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGYG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|148979224|gb|EE026582.2|EE026582
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458134|gb|FL012370.1|FL012370
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTKCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAS-AGTACTTGYCCTGCCGACCTCGACAGCAAATKCGACGGEST: gi|211302409|gb|FL012361.1|FL012361
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAG-ACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGG
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTC-CCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211460651|gb|FL012377.1|FL012377
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458129|gb|FL012365.1|FL012365
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCNAATGCGACGGTEST: gi|211302404|gb|FL012356.1|FL012356
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458132|gb|FL012368.1|FL012368
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAS-AGAACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGEST: gi|211302403|gb|FL012355.1|FL012355
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGA-CTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGG
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCASSAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|32913601|gb|CF018413.1|CF018413
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458133|gb|FL012369.1|FL012369
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCA-SAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211302408|gb|FL012360.1|FL012360
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCA-SAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458135|gb|FL012371.1|FL012371
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|148950087|gb|EC895623.2|EC895623
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|32910736|gb|CF015548.1|CF015548
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211023371|gb|FK982683.1|FK982683
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCASSAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458139|gb|FL012375.1|FL012375
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|76286923|gb|DV026491.1|DV026491
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211460652|gb|FL012378.1|FL012378
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCTCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|21389921|gb|BQ527970.1|BQ527970
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211020954|gb|FK982680.1|FK982680
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458131|gb|FL012367.1|FL012367
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCT-CTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211458137|gb|FL012373.1|FL012373
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTEST: gi|211302406|gb|FL012358.1|FL012358
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
EST: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTG GTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
genomic: GTTTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGGCATCGTCGTTGTTACTGTCCGTCGTGgtaagtcgct ... tccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGT
tgattgggttcagtgacgttgtgtttctgatcctggttcgaccgctccatgccagGTTGCCGCGCAGCAGACTTGCCCTGCCGACCTCGACAGCAAATGCGACGGTGGCGCGCCTGATGACTGGGAGGGGGAATTCTTCCCCGGCGTCCCGAAAA
ttctgat putative branch site (score: 1001)
ccgctcc putative PPT