1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' |
ggggtgtttggtttttagggactaatttttagtccctacattttattccattttagttccaaaattgctaaatatggaaactaaaactctattttaatttctatatttgacaatttatatactaaaatggaataaaatgaagggactaaacattagtcccttgaaaccaaacaccccctcagTCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTTAAGGCCCCGTTTGGTTTGAGGGACTAAAGATTAGTCCCTCCATTTTAGT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G154621_T01 |
intron # | 15 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCCTTATCTCCATGCTCAG TCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGG-AAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTTEST: gi|8551594|gb|BE128939.1|BE128939
genomic: CCCTTATCTCCATGCTCAGggggtgtttg ... accccctcagTCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTT
EST: GGCAGCCGCCGAGGTGGAAATTTTTGTCGACCCCTTATCTCCATGCTCAG TCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTTEST: gi|78180216|gb|DV550589.1|DV550589
genomic: GGCAGCCGCCGAGGTGGAAATTTTTGTCGACCCCTTATCTCCATGCTCAGggggtgtttg ... accccctcagTCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTT
EST: GGCAGCCGCCGAGGTGGAAATTTTTGTCGACCCCTTATCTCCATGCTCAG TCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTTEST: gi|8665683|gb|BE186499.1|BE186499
genomic: GGCAGCCGCCGAGGTGGAAATTTTTGTCGACCCCTTATCTCCATGCTCAGggggtgtttg ... accccctcagTCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTT
EST: GGCAGCCGCCGAGGTGGAAATTTTTGTCGACCCCTTATCTCCATGCTCAG TCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTT
genomic: GGCAGCCGCCGAGGTGGAAATTTTTGTCGACCCCTTATCTCCATGCTCAGggggtgtttg ... accccctcagTCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTT
tggaataaaatgaagggactaaacattagtcccttgaaaccaaacaccccctcagTCAAGCTAAGGTTGTTTAGCGAGGAAAATGTATGGGGTACCTACTGTAGTTAAGGCCCCGTTTGGTTTGAGGGACTAAAGATTAGTCCCTCCATTTTAGT
gactaaa putative branch site (score: 2)
caccccctc putative PPT
taaaatgaa TA-rich tract