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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...atatatatcaatatattacagtgacacaatacacaatatgctaacacagtcaacaatatttgttgcattgcaattttaaacaaaatacattcactttcagGTTAGCCATATCATGGATCCTATAGATGATTCAACATTCAAAAATATCTGGATGGCCACTGCCAAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G066485_T02
intron # 15
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G066485_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 16
lower sequence: LOC_Os05g29050.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 16
atatatatcaatatattacagtgacacaatacacaatatgctaacacagtcaacaatatttgttgcattgc---aattttaaacaaaatacat-tcactttcagGTTAGCCATATCATGGATCCTATAGATGATTCAACATTCAAAAATATCTGGATGGCCACTGCCAAG
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---tatcacgatatgct-tgatgaagctttcttatattcattgcagcagatagggatatcatgtgcattattttgattgtttaaaatataaatgtgatatacagGTCAGCCATATTATGGACCCTATCGATGACTCAACTTTCAAAAATATCTGGATGGCCACTGCTAAG


















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

acagtcaacaatatttgttgcattgcaattttaaacaaaatacattcactttcagGTTAGCCATATCATGGATCCTATAGATGATTCAACATTCAAAAATATCTGGATGGCCACTGCCAAG
                                            ttcactttc  CT-rich tract
                          aattttaaacaaaata  TA-rich tract