1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' |
...aaaaggatggcttttgaacaccaacatgacaattgcttgcaagtaggaggttccaccatatattgaacatccattgttcaatttgtctaattgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGTTTTGATTATCGTCTTCATATGGCTGTCCCAGACAAATGGATTGAACTTC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G073054_T02 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGAT GTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGTEST: gi|101386689|gb|EB815361.1|EB815361
genomic: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGATgtaagtgctc ... ttgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGT
EST: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGAT GTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGTEST: gi|211410788|gb|FL280482.1|FL280482
genomic: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGATgtaagtgctc ... ttgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGT
EST: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGAT GTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGTEST: gi|27753880|gb|BM378072.1|BM378072
genomic: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGATgtaagtgctc ... ttgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGT
EST: ACGATCTTATTTGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGAT GTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGACGGTGGTGTTGGTEST: gi|211410789|gb|FL280483.1|FL280483
genomic: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGATgtaagtgctc ... ttgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGT
EST: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGTAGAT GTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGT
genomic: ACGATCTTATTCGTGGGCTTTATCCAGAAGCTGTATCCATTGGCGAAGATgtaagtgctc ... ttgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGT
ggaggttccaccatatattgaacatccattgttcaatttgtctaattgtgttcagGTCAGCGGAATGCCTACATTTTGTATCCCTGTCCAAGATGGTGGTGTTGGTTTTGATTATCGTCTTCATATGGCTGTCCCAGACAAATGGATTGAACTTC
gtctaat putative branch site (score: 3)
atatattgaa TA-rich tract