1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
gtaagtttgaagagcacctctttcggtgtttgttggatatgggctccaccatatggttagctgcctaataggatggatatccctttttgcttaagtgagagaatgtgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGGGAAGCCTTGCCCTCCAATCTATGTACACTTTATCAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G013890_T01 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|211429009|gb|FL174618.1|FL174618
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|60343993|gb|DN210966.1|DN210966
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCEST: gi|71307301|gb|DR789831.1|DR789831
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATC
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|7216688|gb|AW562810.1|AW562810
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: TTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|60341793|gb|DN208766.1|DN208766
genomic: TTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|211142472|gb|FL453924.1|FL453924
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: CCCTTGATTTGMCGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|12970170|gb|BG266849.1|BG266849
genomic: -CCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|22552549|gb|BU102388.1|BU102388
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|60352803|gb|DN219776.1|DN219776
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|5069942|gb|AI737907.1|AI737907
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|76914779|gb|DV165687.1|DV165687
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|211429008|gb|FL174617.1|FL174617
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GGCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|67015572|gb|CO444321.1|CO444321
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|78544243|gb|DV621741.1|DV621741
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|84980921|gb|DW531270.1|DW531270
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|5108202|gb|AI739915.1|AI739915
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|40336236|gb|CK370306.1|CK370306
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|211429006|gb|FL174615.1|FL174615
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|6859953|gb|AW355947.1|AW355947
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGCGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GATGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGATTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|71307303|gb|DR789832.1|DR789832
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|211429007|gb|FL174616.1|FL174616
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|86472924|gb|DY239294.1|DY239294
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|37390519|gb|CF632491.1|CF632491
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|32943068|gb|CF047887.1|CF047887
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: ACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|211429005|gb|FL174614.1|FL174614
genomic: ACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|20802514|gb|BQ293564.1|BQ293564
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|213187661|gb|FM193141.1|FM193141
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GATGAAGTGCTATCCG GGGGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|37377213|gb|CF625190.1|CF625190
genomic: GATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGEST: gi|7304451|gb|AW600390.1|AW600390
genomic: GCCTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
EST: CTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCG GGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
genomic: CTTGATTTGACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAAGTGCTATCCGgtaagtttga ... tgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCG
ctgcctaataggatggatatccctttttgcttaagtgagagaatgtgtgtggcagGGTGTGCCGGAGCAGAAGTTGAGGGCACATCTGGGTTCGTTTGGTGTTTCGGGAAGCCTTGCCCTCCAATCTATGTACACTTTATCAG
gcctaat putative branch site (score: 215)
taata TA-rich tract