1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
gtaagataagttttctgtatgttttcagcatttatgttgtagattagttctaagaaccactgaataactcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATCAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G094497_T01 |
intron # | 12 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32929245|gb|CF034057.1|CF034057
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|5915388|gb|AW053029.1|AW053029
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|31352565|gb|CD436922.1|CD436922
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|6445489|gb|AW179407.1|AW179407
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32827029|gb|CD966707.1|CD966707
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGGCCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32928465|gb|CF033277.1|CF033277
genomic: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60353112|gb|DN220085.1|DN220085
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|31352616|gb|CD436973.1|CD436973
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32928932|gb|CF033744.1|CF033744
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|67022236|gb|CO450985.1|CO450985
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|211474169|gb|FL062077.1|FL062077
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|67040204|gb|CO466459.1|CO466459
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32929097|gb|CF033909.1|CF033909
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCAGGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|5804536|gb|AI979506.1|AI979506
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: TCTTTC-CGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32944174|gb|CF048993.1|CF048993
genomic: TCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60353085|gb|DN220058.1|DN220058
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: GATTTATCCACCCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32788398|gb|CD940634.1|CD940634
genomic: GATTTATCCA-CCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60358048|gb|DN225021.1|DN225021
genomic: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32838699|gb|CD978380.1|CD978380
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60345561|gb|DN212534.1|DN212534
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|6056572|gb|AW090977.1|AW090977
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|33092363|gb|CF052357.1|CF052357
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32804255|gb|CD956491.1|CD956491
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32928990|gb|CF033802.1|CF033802
genomic: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32944913|gb|CF049732.1|CF049732
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|31352900|gb|CD437257.1|CD437257
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|31351441|gb|CD435798.1|CD435798
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32928322|gb|CF033134.1|CF033134
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTTGGATGTATCTAATEST: gi|211466584|gb|FL062035.1|FL062035
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|5871234|gb|AW017705.1|AW017705
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32799313|gb|CD951549.1|CD951549
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: GTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCAGATGTATCTAATEST: gi|60357117|gb|DN224090.1|DN224090
genomic: GTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|24764051|gb|CA399220.1|CA399220
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: GATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|24934300|gb|CA452518.1|CA452518
genomic: GATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|33101328|gb|CF061288.1|CF061288
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60349999|gb|DN216972.1|DN216972
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: CACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|6021392|gb|AW066320.1|AW066320
genomic: CACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|213171194|gb|FM184433.1|FM184433
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|32802000|gb|CD954236.1|CD954236
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: TAATATCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGGAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60344123|gb|DN211096.1|DN211096
genomic: TAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|33100800|gb|CF060760.1|CF060760
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|60343460|gb|DN210433.1|DN210433
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATEST: gi|31351755|gb|CD436112.1|CD436112
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
EST: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAG AGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
genomic: ATTTATCCACCTATTAATGTCCTGCCATCTCTTTCACGATTGATGAAGgtaagataag ... actcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAAT
ttttcagcatttatgttgtagattagttctaagaaccactgaataactcctgcagAGTGCTATTGGTGAGGGCATGACACGTCGAGACCATTCGGATGTATCTAATCAG
gaataac putative branch site (score: 540)
ctcctgc CT-rich tract
atttatgtt TA-rich tract