1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
gtcataatatacgaacttcaaatccgtgcacagaacatgctcagtattatcttttcccgttgcgtgatagtcacaagggctaaagtgcattctagtaattcaacctatatatatcaatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G432128_T01 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60342210|gb|DN209183.1|DN209183
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|76286555|gb|DV026123.1|DV026123
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|148937600|gb|EC881790.2|EC881790
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60338834|gb|DN205807.1|DN205807
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|37377043|gb|CF625092.1|CF625092
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|8577413|gb|BE130050.1|BE130050
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|21760011|gb|BQ635552.1|BQ635552
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGGTCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60352624|gb|DN219597.1|DN219597
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|211106972|gb|FL115259.1|FL115259
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|67031198|gb|CO459947.1|CO459947
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCA-GAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGGTGEST: gi|32916741|gb|CF021553.1|CF021553
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|5915562|gb|AW053203.1|AW053203
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGGGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|67010786|gb|CO439535.1|CO439535
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|211106971|gb|FL115258.1|FL115258
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|31356012|gb|CD440369.1|CD440369
genomic: GATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGGTCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|33092418|gb|CF052412.1|CF052412
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG G-TTTGGGTCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60352979|gb|DN219952.1|DN219952
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|37377787|gb|CF625533.1|CF625533
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG G-TTTGGATCTTNGGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60343928|gb|DN210901.1|DN210901
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTT-TGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|67023195|gb|CO451944.1|CO451944
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|33098319|gb|CF058279.1|CF058279
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCATGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60358113|gb|DN225086.1|DN225086
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|67025371|gb|CO454120.1|CO454120
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTTGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|148957373|gb|EC903423.2|EC903423
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|74237579|gb|DT645493.1|DT645493
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60346852|gb|DN213825.1|DN213825
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|60347229|gb|DN214202.1|DN214202
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|21891602|gb|BQ744815.1|BQ744815
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGGTCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|67019645|gb|CO448394.1|CO448394
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTGEST: gi|211197469|gb|FL425784.1|FL425784
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
EST: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAG GTTTTGGATCTTTGG
genomic: GGCTTGCAAGAACTACGATGGAGATGTGCAGAGTGATTTCTTAGCTCAAGgtcataatat ... caatgtgcagGTTTTGGATCTTTGG
gtcacaagggctaaagtgcattctagtaattcaacctatatatatcaatgtgcagGTTTTGGATCTTTGGGTTTGATGACATCAGTGTTG
ggctaaa putative branch site (score: 1298)
tatatatatcaatgt TA-rich tract