1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
gtaaacttgggatttgtactgcctcccattttcttatgtgttcagtggttgctttctatggtggtcaaaattattgtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCACCAGTGGCTTCTTATGTTTACCGGAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G063851_T01 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|149084983|gb|EE174493.2|EE174493
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGGCT-CEST: gi|21480820|gb|BQ577503.1|BQ577503
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGG-CTTC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|67013663|gb|CO442412.1|CO442412
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: TTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCT-ATGTACA-TGGATTGCCAAAGTCAA- GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCCGGCTTCEST: gi|78179069|gb|DV549442.1|DV549442
genomic: TTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATG-ACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTC-GGCTTC
EST: TGAC-ATGGATTGCC-AAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|211131286|gb|FL186945.1|FL186945
genomic: TGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|149100799|gb|EE186893.2|EE186893
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGEST: gi|32868179|gb|CF007861.1|CF007861
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTG
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGEST: gi|149014218|gb|EE043773.2|EE043773
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTG
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|149105261|gb|EE290752.2|EE290752
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|148991806|gb|EE033387.2|EE033387
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: TTGAGAGTGAATTTTCAAA-GGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTEST: gi|148931316|gb|EC874179.2|EC874179
genomic: TTGAGAGTGAATTT-CAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACT
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTC-EST: gi|6964715|gb|AW433408.1|AW433408
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: TGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTT--GAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|78087725|gb|DV516118.1|DV516118
genomic: TGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTC-EST: gi|7238183|gb|AW573405.1|AW573405
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|71771089|gb|DR969026.1|DR969026
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCEST: gi|7145414|gb|AW506895.1|AW506895
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|67040702|gb|CO466957.1|CO466957
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCEST: gi|89758059|gb|DY687401.1|DY687401
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCC
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTEST: gi|149082974|gb|EE172211.2|EE172211
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTT
EST: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAA GTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTC
genomic: GTTGAGAGTGAATTTCAAAAGGCTTATGACAATGGATTGCCAAAGTCAAAgtaaacttgg ... gtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTC
ttcttatgtgttcagtggttgctttctatggtggtcaaaattattgtttgtatagGTTTTGGGAGCCTACTTATGAAGACTGCTTAAATTTGATTGCTCGGCTTCCACCAGTGGCTTCTTATGTTTACCGGAG
aaaattattgtttgta TA-rich tract