1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtaagttttgagtggatgaacgctaatgcagcagaagattggaaacattaactggctatttcttgtgtggccacataatcagGACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAACCTGCCCTTTTGTACATCGTGCCCTTCACTCTTGGTAATGATGTGTGTTT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G165351_T02 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGTTACTTTTTGTGGGCAATGGTGGCCTATGGCTCTG GACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAACEST: gi|32843028|gb|CD982709.1|CD982709
genomic: GGTTACTTTTTGTGGGCAATGGTGGCCTATGGCTCTGgtaagttttg ... acataatcagGACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAAC
EST: GGGCTTACGGTCTGGTTACTTTTTGTGGGCAATGGTGGCCTATGGCTCTG GACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAACEST: gi|32848049|gb|CD987730.1|CD987730
genomic: GGGCTTACGGTCTGGTTACTTTTTGTGGGCAATGGTGGCCTATGGCTCTGgtaagttttg ... acataatcagGACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAAC
EST: GGGCTTACGGTCTGGTTACTTTTTGTGGGCAATGGTGGCCTATGGCTCTG GACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAAC
genomic: GGGCTTACGGTCTGGTTACTTTTTGTGGGCAATGGTGGCCTATGGCTCTGgtaagttttg ... acataatcagGACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAAC
gcagcagaagattggaaacattaactggctatttcttgtgtggccacataatcagGACTTCTAATCACATATGTTGCGCTGAACCTGATGGATGGGCATGGACAACCTGCCCTTTTGTACATCGTGCCCTTCACTCTTGGTAATGATGTGTGTTT
cattaac putative branch site (score: 2)
aaacattaa TA-rich tract