1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtaggttcctgtttgagataatgggataatgaaaagtgaatcatgcattgcttaattagaaactgggtattctgtttttcctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCTTTGTTGGGATCTCCTTGCTAGCACCCGATGACACTAAAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G144254_T02 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|93281607|gb|EB673871.1|EB673871
genomic: GTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|32844477|gb|CD984158.1|CD984158
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: ACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|5296213|gb|AI782893.1|AI782893
genomic: ACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|6227147|gb|AW155676.1|AW155676
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|113701592|gb|EE679096.1|EE679096
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|211277446|gb|FL309933.1|FL309933
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|60350817|gb|DN217790.1|DN217790
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|60356320|gb|DN223293.1|DN223293
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|19822362|gb|BQ048386.1|BQ048386
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|32844487|gb|CD984168.1|CD984168
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: ACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|19822356|gb|BQ048380.1|BQ048380
genomic: ACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCEST: gi|78022546|gb|DV490933.1|DV490933
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
EST: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAA GTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
genomic: GGACCTTCTTCTCTATCTGTACAGGATTTGTTTACTTTCAAGAATATCAAgtaggttcct ... cctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTC
agtgaatcatgcattgcttaattagaaactgggtattctgtttttcctctgtcagGTATTTGATACGCTCAGGATAATTATGGTTGTATTGGGCATGACATTTGTCTTTGTTGGGATCTCCTTGCTAGCACCCGATGACACTAAAG
gcttaat putative branch site (score: 74)
ttctgtttttcctctg putative PPT
ttaattagaaa TA-rich tract