Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgtcctgcacatgcatccttgttcgttggttcagcaactgaagatttgcatgatgttttggctcgtcttacatttatcatgcatccttgttcgcttggtcagacagtaatttgtctctgctacgtgtctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGAGAGACGAGAAGGCTCGTGGGCACTTGAACAGCAAATCCTCTTTTCCCG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G119759_T06
intron # 10
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G119759_T06 (Zea mays), 3'ss of exon 10
lower sequence: LOC_Os04g58700.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 11
gtatgtcctgcacatgcatccttgttcgttggttcagcaactgaagatttgcatgatgttttggctcgtcttacatttatcatgca-tccttgttcgcttggtcagacagtaatttgtctctgctacgtgtctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGAGAGACGAGAAGGCTCGTGGGCACTTGAACAGCAAATCCTCTTTTCCCG---------
           |  |||| | || ||  |||||||  ||     ||  || | |  | | ||    |    ||   |||   |||| | ||      | |||| | |||  ||      | |  | | | | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||          | | | |||||||||| ||| | | | || | |||||||||||| || |         
--------gtaaggtgca-cgttattt-ttggttcttcagagatagcctttccttgtctgttcatcc---ctatccttagagtgcaatactctccaacctggtgaaaca--aacacaattgttttccatttttgttttcagCTGGTTGATTTTGAGTGCTGGAAAATGATGTTCACCAAACA---------AAAACATGAGAAGGCTCCTGGCCGCATCAATAACAAATCCTCTTTCCCTGGCCACTTGG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|45846935|gb|CN070878.1|CN070878
EST:     CTCCGTGTACGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149107663|gb|EE189542.2|EE189542
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|91050218|gb|EB160636.1|EB160636
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|88746982|gb|DY531123.1|DY531123
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|71770668|gb|DR968605.1|DR968605
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|71313398|gb|DR793250.1|DR793250
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149097230|gb|EE183048.2|EE183048
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149051626|gb|EE155736.2|EE155736
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|78089519|gb|DV517893.1|DV517893
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|148950050|gb|EC895582.2|EC895582
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|50334832|gb|CO529958.1|CO529958
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|71761155|gb|DR959092.1|DR959092
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|88757283|gb|DY541424.1|DY541424
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|60356012|gb|DN222985.1|DN222985
EST:     CTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|71330749|gb|DR802161.1|DR802161
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149106783|gb|EE188679.2|EE188679
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|101388114|gb|EB816071.1|EB816071
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149013195|gb|EE042830.2|EE042830
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149097302|gb|EE183131.2|EE183131
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|78122547|gb|DV540931.1|DV540931
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|50335669|gb|CO530795.1|CO530795
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|44901335|gb|CK827880.1|CK827880
EST:     GGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: GGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|148943639|gb|EC888703.2|EC888703
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|78084470|gb|DV512863.1|DV512863
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|40334564|gb|CK368634.1|CK368634
EST:     GGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: GGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149004762|gb|EE039259.2|EE039259
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|86472200|gb|DY238570.1|DY238570
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149095721|gb|EE181354.2|EE181354
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|76910133|gb|DV163719.1|DV163719
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|148975399|gb|EE025699.2|EE025699
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|74242567|gb|DT650481.1|DT650481
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149031687|gb|EE154870.2|EE154870
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149074933|gb|EE163389.2|EE163389
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|94474040|gb|EB702998.1|EB702998
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|110963269|gb|EE183169.1|EE183169
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149089831|gb|EE179109.2|EE179109
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|71760111|gb|DR958048.1|DR958048
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|149111973|gb|EE191133.2|EE191133
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|148999085|gb|EE024226.2|EE024226
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: gi|91875214|gb|EB405171.1|EB405171
EST:     CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG                         CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atccttgttcgcttggtcagacagtaatttgtctctgctacgtgtctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGAGAGACGAGAAGGCTCGTGGGCACTTGAACAGCAAATCCTCTTTTCCCG
                                            tctgttt  CT-rich tract
                      agtaattt  TA-rich tract