1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatgtcctgcacatgcatccttgttcgttggttcagcaactgaagatttgcatgatgttttggctcgtcttacatttatcatgcatccttgttcgcttggtcagacagtaatttgtctctgctacgtgtctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGAGAGACGAGAAGGCTCGTGGGCACTTGAACAGCAAATCCTCTTTTCCCG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G119759_T03 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTCCGTGTACGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149107663|gb|EE189542.2|EE189542
genomic: CTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|91050218|gb|EB160636.1|EB160636
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|88746982|gb|DY531123.1|DY531123
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|71770668|gb|DR968605.1|DR968605
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|71313398|gb|DR793250.1|DR793250
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149097230|gb|EE183048.2|EE183048
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149051626|gb|EE155736.2|EE155736
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|78089519|gb|DV517893.1|DV517893
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|148950050|gb|EC895582.2|EC895582
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|50334832|gb|CO529958.1|CO529958
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|71761155|gb|DR959092.1|DR959092
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|88757283|gb|DY541424.1|DY541424
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|60356012|gb|DN222985.1|DN222985
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|71330749|gb|DR802161.1|DR802161
genomic: CTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149106783|gb|EE188679.2|EE188679
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|101388114|gb|EB816071.1|EB816071
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149013195|gb|EE042830.2|EE042830
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149097302|gb|EE183131.2|EE183131
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|78122547|gb|DV540931.1|DV540931
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|50335669|gb|CO530795.1|CO530795
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|44901335|gb|CK827880.1|CK827880
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: GGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|148943639|gb|EC888703.2|EC888703
genomic: GGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|78084470|gb|DV512863.1|DV512863
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|40334564|gb|CK368634.1|CK368634
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: GGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149004762|gb|EE039259.2|EE039259
genomic: GGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|86472200|gb|DY238570.1|DY238570
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149095721|gb|EE181354.2|EE181354
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|76910133|gb|DV163719.1|DV163719
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|148975399|gb|EE025699.2|EE025699
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|74242567|gb|DT650481.1|DT650481
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149031687|gb|EE154870.2|EE154870
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149074933|gb|EE163389.2|EE163389
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|94474040|gb|EB702998.1|EB702998
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|110963269|gb|EE183169.1|EE183169
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149089831|gb|EE179109.2|EE179109
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|71760111|gb|DR958048.1|DR958048
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|149111973|gb|EE191133.2|EE191133
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|148999085|gb|EE024226.2|EE024226
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGEST: gi|91875214|gb|EB405171.1|EB405171
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
EST: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAG CTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
genomic: CTGAGCTGAATTCGAACTCCGTGTATGTTACGGAAGATTTTACTCCAAAGgtatgtcctg ... ctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCG
atccttgttcgcttggtcagacagtaatttgtctctgctacgtgtctgtttgcagCTGGTGGATTTTGAATGCTGGAAAATGATGTTCTCGAGACACTCCATCTCGAGAGACGAGAAGGCTCGTGGGCACTTGAACAGCAAATCCTCTTTTCCCG
tctgttt CT-rich tract
agtaattt TA-rich tract