1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
...cctttttaatcaccatgtatcatgctcgtatctgtggaaaaaggaagaggtaaactttaattatttttaactgaattctcttttcctttgttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTGTTGGCTGCAAGGGATGCTTGCCTTGAGATAAGGCTTCACATGCGAGAGA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G030839_T01 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAG TGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTGEST: gi|93281730|gb|EB673994.1|EB673994
genomic: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTG
EST: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCCTCTCACATATGGGAAG TGGGCAGAGGTGGCTACTAACCCACATCAAGA-TTAATTATAEST: gi|78021524|gb|DV489911.1|DV489911
genomic: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATA
EST: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAG TGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTGEST: gi|6020336|gb|AW065264.1|AW065264
genomic: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTG
EST: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAG TGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTGEST: gi|93281729|gb|EB673993.1|EB673993
genomic: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTG
EST: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAG TGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTGEST: gi|211002004|gb|FL458771.1|FL458771
genomic: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTG
EST: TCACATATGGGAAG TGGGCAGAAGTGGCTACTAACCCAACATCAAGAATTATTTATAAGATCATTEST: gi|31664553|gb|CD573486.1|CD573486
genomic: TCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAA-CCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATT
EST: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAG TGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTG
genomic: AAGCATATGAGTCCATGGTGAGGTCCTGTAGTCGTCTCACATATGGGAAGgtaactatgt ... ttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTG
agaggtaaactttaattatttttaactgaattctcttttcctttgttctctgcagTGGGCAGAGGTGGCTACTAACCAACATCAAGAATTAATTATAAGATCATTGTTGGCTGCAAGGGATGCTTGCCTTGAGATAAGGCTTCACATGCGAGAGA
ttttaac putative branch site (score: 2)
ttctcttttcctttgt putative PPT
taaactttaattattt TA-rich tract