Sequence
atgc intronic sequence ATGC exonic sequence...tactgacataacgtagcatatattccctttgtctgattatattattcgacttggcaatgttttggattatttagattcacagtatattctttgtatctagACGCAAGTAATGTCCAGATTGACCTTATCAGAATGCTGCTGCCGGATCAATCGAAGGGGGTGCTGGAGTGGAGGAGGAAAGATCTGTTTGCTCAGGTCTA
Basic information
Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|211414709|gb|FL451625.1|FL451625EST: ACGACTCGCCGCCCGATCAGAAGATCCCCTTCCACCACGAGATGGCTCAG ACGCAAGTAATGTCCAGATTGACCTTATCAGAATGCTGCTGCCGGATCAAT
genomic: ACGACTCGCCGCCCGATCAGAAGATCCCCTTCCACCACGAGATGGCTCAGgtaatcgact ... ttgtatctagACGCAAGTAATGTCCAGATTGACCTTATCAGAATGCTGCTGCCGGATCAAT
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.tcgacttggcaatgttttggattatttagattcacagtatattctttgtatctagACGCAAGTAATGTCCAGATTGACCTTATCAGAATGCTGCTGCCGGATCAATCGAAGGGGGTGCTGGAGTGGAGGAGGAAAGATCTGTTTGCTCAGGTCTA
tattcttt CT-rich tract
ttttggattattta TA-rich tract
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
tactgacataacgtagcatatattccctttgtctgattatattattcgacttggcaatgttttggattatttagattcacagtatattctttgtatctagACGCAAGTAATGTCCAGATTGACCTTATCAGAATGCTGCTGCCGGATCAATCGAAGGGGGTGCTGGAGTGGAGGAGGAAAGATCTGTTTGCTCAGGTCTA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
tactgac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgttttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gattcac