Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gttttaattagtatgttattgcatttttaatgtttgcttgctgttaaggttgctagtttcattgaactaatcgtattgtttgggttttgctgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTGAAGGAAGTCTCTTCCTACCTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGATAAGA

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G153541_T06
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G153541_T06 (Zea mays), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA16G07350.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
gttttaattagtatgttattgcatttttaatgtttgcttgctgttaaggttgctagtttcattgaactaatcgtattgtttgggttttgctgtttt-----acagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTGAAGGAAGTCTCTTCCTACCTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGATAAGA
  | ||||     | ||| | |||   ||    |||||   ||||||| ||  |  |||  | |   |  ||  ||  | |  ||| ||   ||||     |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| || ||||
-gtataatcctggtcttagt-cataaatacc--ttgctgtatgttaagattatttatttagtagctgttttctaatgatgtaagttgtgaaatttttgttgacagATGGATGCCACTACCCCAAAGTACTCTAAGGCCAGGTATGAAGAAATTGTGAAGGAAGTTTCTTCCTACTTGAAGAAGGTAGGTTACAACCCAGACAAGA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|21390177|gb|BQ528226.1|BQ528226
EST:     TCCTTGCTTTCACAC-TGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32935110|gb|CF039922.1|CF039922
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31360021|gb|CD444378.1|CD444378
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|60398438|gb|DN231254.1|DN231254
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33093753|gb|CF053747.1|CF053747
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAGCAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32943637|gb|CF048456.1|CF048456
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31612089|gb|CD568711.1|CD568711
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGG-GTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32933535|gb|CF038347.1|CF038347
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTACGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32848838|gb|CD988519.1|CD988519
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33095746|gb|CF055740.1|CF055740
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33103871|gb|CF063831.1|CF063831
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31353584|gb|CD437941.1|CD437941
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|19057731|gb|BM736398.1|BM736398
EST:     CTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: CTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32846141|gb|CD985822.1|CD985822
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|87157538|gb|DY402327.1|DY402327
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|211219521|gb|FL283032.1|FL283032
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|67042961|gb|CO469216.1|CO469216
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|26558729|gb|CA830964.1|CA830964
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGGCCCGTTATGATGAGATTGT
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAA-GGCCCGTTATGATGAGATTGT
EST: gi|32847878|gb|CD987559.1|CD987559
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33104353|gb|CF064313.1|CF064313
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCACCAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32850197|gb|CD989878.1|CD989878
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32944939|gb|CF049758.1|CF049758
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32930218|gb|CF035030.1|CF035030
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31355798|gb|CD440155.1|CD440155
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32939528|gb|CF044347.1|CF044347
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGCCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32931393|gb|CF036205.1|CF036205
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|67013835|gb|CO442584.1|CO442584
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32850123|gb|CD989804.1|CD989804
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33101962|gb|CF061922.1|CF061922
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|22521607|gb|BU080418.1|BU080418
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33102306|gb|CF062266.1|CF062266
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|6993915|gb|AW453129.1|AW453129
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGCATGCTACTACACCCAAGTATTCCAAGGCCCGNTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|5268791|gb|AI770755.1|AI770755
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         AAGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|213169991|gb|FM189036.1|FM189036
EST:     GGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: GGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32833439|gb|CD973117.1|CD973117
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32943197|gb|CF048016.1|CF048016
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33101738|gb|CF061698.1|CF061698
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|23199660|gb|BU582225.1|BU582225
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32938262|gb|CF043081.1|CF043081
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGTTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33094258|gb|CF054252.1|CF054252
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|22819812|gb|BU499902.1|BU499902
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|22546585|gb|BU098896.1|BU098896
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|211219522|gb|FL283033.1|FL283033
EST:     CTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: CTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32849207|gb|CD988888.1|CD988888
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32935219|gb|CF040031.1|CF040031
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32938127|gb|CF042946.1|CF042946
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32847329|gb|CD987010.1|CD987010
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32934306|gb|CF039118.1|CF039118
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33103295|gb|CF063255.1|CF063255
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGTTACTACACCCAAGTATTCTAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|60348589|gb|DN215562.1|DN215562
EST:     TTGCTGCTGC-ACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33093564|gb|CF053558.1|CF053558
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTACAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32847698|gb|CD987379.1|CD987379
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACTCCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33104338|gb|CF064298.1|CF064298
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32929889|gb|CF034701.1|CF034701
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGGG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32847002|gb|CD986683.1|CD986683
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32849211|gb|CD988892.1|CD988892
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|22545928|gb|BU098287.1|BU098287
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32847249|gb|CD986930.1|CD986930
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33093617|gb|CF053611.1|CF053611
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTGTGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33094058|gb|CF054052.1|CF054052
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32945382|gb|CF050201.1|CF050201
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32944646|gb|CF049465.1|CF049465
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33103811|gb|CF063771.1|CF063771
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCTAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31612186|gb|CD568808.1|CD568808
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32930923|gb|CF035735.1|CF035735
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32922094|gb|CF026906.1|CF026906
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|21389964|gb|BQ528013.1|BQ528013
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|60344704|gb|DN211677.1|DN211677
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31353464|gb|CD437821.1|CD437821
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31360429|gb|CD444786.1|CD444786
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32943730|gb|CF048549.1|CF048549
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|60346784|gb|DN213757.1|DN213757
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32943302|gb|CF048121.1|CF048121
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33102335|gb|CF062295.1|CF062295
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGGTTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|13490539|gb|BG517303.1|BG517303
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|31349432|gb|CD433789.1|CD433789
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33095574|gb|CF055568.1|CF055568
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32929518|gb|CF034330.1|CF034330
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32848646|gb|CD988327.1|CD988327
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|213170251|gb|FM184568.1|FM184568
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33103736|gb|CF063696.1|CF063696
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|33092569|gb|CF052563.1|CF052563
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|22489655|gb|BU049591.1|BU049591
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTAC
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTAC
EST: gi|32847317|gb|CD986998.1|CD986998
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|29543999|gb|CB604379.1|CB604379
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGG-GTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32939426|gb|CF044245.1|CF044245
EST:     TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
EST: gi|32847038|gb|CD986719.1|CD986719
EST:     TCCTTGCTTTCACGCTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAG                         ATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG
genomic: TCCTTGCTTTCACACTTGGTGTGAAGCAGATGATTTGCTGCTGCAACAAGgtatgattcc ... tgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aaggttgctagtttcattgaactaatcgtattgtttgggttttgctgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTGAAGGAAGTCTCTTCCTACCTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGATAAGA
                   aactaat  putative branch site (score: 2)
                                       ttttgct  putative PPT
                            tattgttt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gttttaattagtatgttattgcatttttaatgtttgcttgctgttaaggttgctagtttcattgaactaatcgtattgtttgggttttgctgttttacagATGGATGCTACTACACCCAAGTATTCAAAGGCCCGTTATGATGAGATTGTGAAGGAAGTCTCTTCCTACCTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGATAAGA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG