1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtggcgtgattcggtgattttttctataggatttcgatgcggattccttgatctgcgtttctactgcatgttgatgcctgcagGATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTTCTTTGTTGAATTTCGTGGGCCTAACGAAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G150867_T01 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTCCAAGCAAGCGCCGGGAGATGGACCTCATG-A------A-G---CT- GATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTTEST: gi|211427763|gb|FL233521.1|FL233521
genomic: TCTCCAAGCAAGCGCCGGGAGATGGACCTCATGAAGCTGTGAGGATTCTGgtggcgtgat ... atgcctgcagGATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTT
EST: TCTCCAAGCAAGCGCCGGGAGATGGACCTCATGAAGCTGTGAGGATTCTG GATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTTEST: gi|37394410|gb|CF634479.1|CF634479
genomic: TCTCCAAGCAAGCGCCGGGAGATGGACCTCATGAAGCTGTGAGGATTCTGgtggcgtgat ... atgcctgcagGATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTT
EST: TCTCCAAGCAAGCGCCGGGAGATGGACCTCATG-A------A-G---CT- GATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTT
genomic: TCTCCAAGCAAGCGCCGGGAGATGGACCTCATGAAGCTGTGAGGATTCTGgtggcgtgat ... atgcctgcagGATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTT
ggatttcgatgcggattccttgatctgcgtttctactgcatgttgatgcctgcagGATGATGAGCGACTACAAGGTGGATATGGTGAACGATGGGATGCAGGAGTTCTTTGTTGAATTTCGTGGGCCTAACGAAA
tgttgat putative branch site (score: 4)