Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tttcagtttgtagcgttattcatgctaccatcattggcttgcatatttggttttaaacacaataaatgtattgcactaatggaatcaactaaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G105019_T01
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G105019_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA16G29450.2 (Glycine max), 3'ss of exon 1
tttcagtttgtagcgttattcatgctaccatcattggcttgcatatttggttttaaacacaataaatgtattgcactaatggaatcaactaaacttc---cagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG
 |   |||| |   ||  ||||||    | |  | | | ||    | |  | ||  ||  ||| | |  |||     ||   |||   ||    ||    |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  || ||    | |  ||||| || |  ||||||||
atggtgtttattttgt-gttcatggcgtcct-gtagacatgtggttgtaatgttttac-taattactaaattttgggaactaaattttcttgcttttgtgcagAGGCTGTTGCTGATGCTAACAAAGCAATTGAATTGAATTCTTCTCTACCAAAAGCATATTTGCGGAAAGG

upper sequence: GRMZM2G105019_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA09G23980.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
tttcagtttgtagcgt-tattcatgctaccatcattggcttgcatatttggttttaaacacaata--aatgtattgcactaatggaatcaactaaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG
 |   || | ||   | ||||||||   || |    | | ||    | |  | ||  ||  | ||  ||| |   | ||||||    |    |     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||    | |  ||||| || |  ||||||||
atatggtgtttattttgtattcatggcgccct-gcagacatgtggttgtaatgtttgactaattactaattttgggaactaattttcttgctt--ttgtgcagAGGCTGTGGCTGATGCTAACAAAGCAATTGAATTGAATCCTTCTCTACCAAAAGCATATTTGCGGAAAGG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211027354|gb|FL173897.1|FL173897
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398161|gb|FL173842.1|FL173842
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|67041846|gb|CO468101.1|CO468101
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024886|gb|FL173871.1|FL173871
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398170|gb|FL173851.1|FL173851
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392922|gb|FL173824.1|FL173824
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|67031272|gb|CO460021.1|CO460021
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395543|gb|FL173833.1|FL173833
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32809136|gb|CD961370.1|CD961370
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032262|gb|FL173915.1|FL173915
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|149074736|gb|EE163165.2|EE163165
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024887|gb|FL173872.1|FL173872
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024897|gb|FL173882.1|FL173882
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|31358963|gb|CD443320.1|CD443320
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024899|gb|FL173884.1|FL173884
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392916|gb|FL173818.1|FL173818
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032266|gb|FL173919.1|FL173919
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398165|gb|FL173846.1|FL173846
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024893|gb|FL173878.1|FL173878
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCG-ACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATSCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|5901292|gb|AW042392.1|AW042392
EST:     GCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGNGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: GCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398164|gb|FL173845.1|FL173845
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029796|gb|FL173908.1|FL173908
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032269|gb|FL173922.1|FL173922
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398163|gb|FL173844.1|FL173844
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|149000611|gb|EE037809.2|EE037809
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027347|gb|FL173890.1|FL173890
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211022430|gb|FL173855.1|FL173855
EST:     MCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32804177|gb|CD956413.1|CD956413
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395539|gb|FL173829.1|FL173829
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|6021590|gb|AW066518.1|AW066518
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32826916|gb|CD966594.1|CD966594
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGCGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027355|gb|FL173898.1|FL173898
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|60354886|gb|DN221859.1|DN221859
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|148952074|gb|EC897865.2|EC897865
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024894|gb|FL173879.1|FL173879
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024889|gb|FL173874.1|FL173874
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392914|gb|FL173816.1|FL173816
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|149095998|gb|EE181667.2|EE181667
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029802|gb|FL173914.1|FL173914
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029791|gb|FL173903.1|FL173903
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398168|gb|FL173849.1|FL173849
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGSACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024885|gb|FL173870.1|FL173870
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029800|gb|FL173912.1|FL173912
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398173|gb|FL173854.1|FL173854
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029788|gb|FL173900.1|FL173900
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGSACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211022433|gb|FL173858.1|FL173858
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395544|gb|FL173834.1|FL173834
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|15554147|gb|BI644145.1|BI644145
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32826612|gb|CD966290.1|CD966290
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392919|gb|FL173821.1|FL173821
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGSACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|22819579|gb|BU499669.1|BU499669
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392918|gb|FL173820.1|FL173820
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027342|gb|FL173885.1|FL173885
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032268|gb|FL173921.1|FL173921
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395546|gb|FL173836.1|FL173836
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACATTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395535|gb|FL173825.1|FL173825
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGSACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029790|gb|FL173902.1|FL173902
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032265|gb|FL173918.1|FL173918
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392917|gb|FL173819.1|FL173819
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029798|gb|FL173910.1|FL173910
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024891|gb|FL173876.1|FL173876
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027346|gb|FL173889.1|FL173889
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029793|gb|FL173905.1|FL173905
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|149014157|gb|EE043702.2|EE043702
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395540|gb|FL173830.1|FL173830
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398167|gb|FL173848.1|FL173848
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024896|gb|FL173881.1|FL173881
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395545|gb|FL173835.1|FL173835
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029801|gb|FL173913.1|FL173913
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTTGAGCTTGATCCTATGATGCAT
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATT-GAGCTTGATCCTATGATGCAT
EST: gi|211024895|gb|FL173880.1|FL173880
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027352|gb|FL173895.1|FL173895
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395548|gb|FL173838.1|FL173838
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGC
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGC
EST: gi|211022443|gb|FL173868.1|FL173868
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCNAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395536|gb|FL173826.1|FL173826
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029799|gb|FL173911.1|FL173911
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032264|gb|FL173917.1|FL173917
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398160|gb|FL173841.1|FL173841
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211022440|gb|FL173865.1|FL173865
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32824337|gb|CD964059.1|CD964059
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024892|gb|FL173877.1|FL173877
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395549|gb|FL173839.1|FL173839
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392915|gb|FL173817.1|FL173817
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027351|gb|FL173894.1|FL173894
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392921|gb|FL173823.1|FL173823
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024898|gb|FL173883.1|FL173883
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATT-AGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211032267|gb|FL173920.1|FL173920
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027345|gb|FL173888.1|FL173888
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027349|gb|FL173892.1|FL173892
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|71429578|gb|DR810628.1|DR810628
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398171|gb|FL173852.1|FL173852
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027344|gb|FL173887.1|FL173887
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398172|gb|FL173853.1|FL173853
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGSACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395538|gb|FL173828.1|FL173828
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|148995931|gb|EE035174.2|EE035174
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398169|gb|FL173850.1|FL173850
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211022434|gb|FL173859.1|FL173859
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029792|gb|FL173904.1|FL173904
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029789|gb|FL173901.1|FL173901
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|5932648|gb|AW057009.1|AW057009
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398166|gb|FL173847.1|FL173847
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211398159|gb|FL173840.1|FL173840
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211024890|gb|FL173875.1|FL173875
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGSACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|86467579|gb|DY233949.1|DY233949
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGAAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCATTTGATCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32827004|gb|CD966682.1|CD966682
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211029795|gb|FL173907.1|FL173907
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027350|gb|FL173893.1|FL173893
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211022436|gb|FL173861.1|FL173861
EST:     CCTCTATGTCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211027353|gb|FL173896.1|FL173896
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211395542|gb|FL173832.1|FL173832
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|32803959|gb|CD956195.1|CD956195
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|148936646|gb|EC880771.2|EC880771
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
EST: gi|211392920|gb|FL173822.1|FL173822
EST:     CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTG                         AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA
genomic: CCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATA

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 583

GCCACCGAGCTCTACAGCCAGGCCATCGACGCCGGGCCCGCCACCGCCGACCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 852

GCCACCGAGCTCTACAGCCAGGCCATCGACGCCGGGCCCGCCACCGCCGACCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1031

GCCACCGAGCTCTACAGCCAGGCCATCGACGCCGGGCCCGCCACCGCCGACCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 362

GCCACCGAGCTCTACAGCCAGGCCATCGACGCCGGGCCCGCCACCGCCGACCTCTATGCCGACCGCGCCCAGGCGCACATCAAGCTCGGCAACTACACTGgtacgggcag ... aaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG




 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tttggttttaaacacaataaatgtattgcactaatggaatcaactaaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG
                                         aactaaa  putative branch site (score: 362)
                                                cttcc  CT-rich tract
     ttttaaacacaataaa  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tttcagtttgtagcgttattcatgctaccatcattggcttgcatatttggttttaaacacaataaatgtattgcactaatggaatcaactaaacttccagAGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGCTT
- - - - - - - - - ttcatgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - gcttgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -caataaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgcacta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aatcaac