1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...aatttcacactgcacattgttgatattagtttgttataaattatagtggtttataattaagtaaagtagtaagtaagtgtatgtgcaatgttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGGGTCATATCCTGAGCGACCAGGTGAACCCGACTGCACTTACTATCTCAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G087032_T03 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAG AGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGEST: gi|31357454|gb|CD441811.1|CD441811
genomic: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAGgttagggatt ... ttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
EST: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAG AGGGGATGTGGCAACAGATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
genomic: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAGgttagggatt ... ttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
gtggtttataattaagtaaagtagtaagtaagtgtatgtgcaatgttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGGGTCATATCCTGAGCGACCAGGTGAACCCGACTGCACTTACTATCTCAG
tgttgat putative branch site (score: 4)
ttataattaagtaaag TA-rich tract